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猪T细胞受体β链基因的克隆及生物信息学分析
引用本文:李玩生,刘磊,冯海燕,房永祥,景志忠.猪T细胞受体β链基因的克隆及生物信息学分析[J].甘肃农业大学学报,2010,45(3).
作者姓名:李玩生  刘磊  冯海燕  房永祥  景志忠
作者单位:1. 甘肃农业大学动物医学院,甘肃,兰州,730070;中国农业科学院兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,甘肃省动物寄生虫病重点实验室,甘肃,兰州,730046
2. 甘肃农业大学动物医学院,甘肃,兰州,730070
3. 中国农业科学院兰州兽医研究所,家畜疫病病原生物学国家重点实验室,甘肃省动物寄生虫病重点实验室,甘肃,兰州,730046
基金项目:国家高新技术"863"项目,国家支撑计划项目 
摘    要:以GenBank上登载的猪的T细胞受体β(pTCR-β)基因为参考序列,用RT-PCR法从猪的外周血淋巴细胞中克隆了TCR-β链基因,并进行生物信息学分析.结果表明:pTCR-β基因含有一个完整的开放阅读框架(ORF),大小为849bp,编码283个氨基酸,且含有一段27个氨基酸的信号肽序列,与参考序列相比,在核苷酸序列上的同源性为80.4%,在氨基酸序列上的同源性为70.3%;生物信息学结构预测发现2个结构域,一个为IG结构域,由第32-138位共107个氨基酸残基组成;另一个为IG-LIKE结构域,由第164-211位共48个氨基酸残基组成.

关 键 词:猪TCR-β链基因  基因克隆  生物信息学  结构预测

Cloning and bioinformatics analysis of porcine T cell receptor beta chain gene
LI Wan-sheng,LIU Lei,FENG Hai-yan,FANG Yong-xiang,JING Zhi-zhong.Cloning and bioinformatics analysis of porcine T cell receptor beta chain gene[J].Journal of Gansu Agricultural University,2010,45(3).
Authors:LI Wan-sheng  LIU Lei  FENG Hai-yan  FANG Yong-xiang  JING Zhi-zhong
Institution:LI Wan-sheng1,2,LIU Lei1,FENG Hai-yan2,FANG Yong-xiang2,JING Zhi-zhong2(1.College of Veterinary Medine,Gansu Agricultural University,Lanzhou 730070,China,2.Key Laboratory of Veterinary Parasitology of Gansu Province,Key Laboratory of Veterinary Public Health of Ministry of Agriculture,State Key Laboratory of Veterinary Etiological Biology,Lanzhou Veterinary Research Institute,CAAS,Lanzhou 730046,China)
Abstract:
Keywords:porcine T cell receptor beta chain gene  gene cloning  bioinformatics  structure prediction  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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