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基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系
引用本文:陈鲆,曾如奎,杨德英,哈西,罗文杰,徐丹,刘飞,秦云鑫,熊金鑫,丁文祥,黄俊杰,刘日,唐子婷,何智,严太明.基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系[J].四川农业大学学报,2024(1):140-148.
作者姓名:陈鲆  曾如奎  杨德英  哈西  罗文杰  徐丹  刘飞  秦云鑫  熊金鑫  丁文祥  黄俊杰  刘日  唐子婷  何智  严太明
作者单位:1. 四川农业大学动物科技学院;2. 长江上游鱼类资源与环境四川省野外科学观测研究站;3. 雅砻江流域水电开发有限公司
基金项目:国家自然科学基金(31972777);
摘    要:【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化系数和基因流等,分析种间进化关系和种内遗传多样性。【结果】叶须鱼属每个种的cytb序列单独聚为一支,表明cytb基因序列能将叶须鱼属5个种区分开;种间高度遗传分化(Fst>0.25),物种之间基因流较弱(Nm<1);修长叶须鱼遗传多样性水平最高,锥吻叶须鱼遗传多样性水平最低。基于rag2基因序列的分子系统发育进化树显示,修长叶须鱼和裸腹叶须鱼均单独聚为一支,为独立的种。【结论】cytb和rag2可作为叶须鱼属种间鉴定的分子标记基因,这为叶须鱼属物种的鉴定和系统分类奠定了基础,也为叶须鱼属鱼类保护措施的制定提供了遗传学依据。

关 键 词:叶须鱼属  cytb基因  rag2基因  系统发育关系  遗传多样性
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