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基因组步移技术克隆稀有鮈鲫角蛋白18基因序列及序列分析
引用本文:叶 莹,蔡生力,刘 红.基因组步移技术克隆稀有鮈鲫角蛋白18基因序列及序列分析[J].上海海洋大学学报,2011,20(5):661-668.
作者姓名:叶 莹  蔡生力  刘 红
作者单位:上海海洋大学 农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室;上海海洋大学 农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室;上海海洋大学 农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室
基金项目:上海市教育委员会重点学科建设项目(J50701)
摘    要:角蛋白18是角蛋白的一种,属于S型角蛋白,是在哺乳动物和两栖类动物胚胎发育中第一个表达的中间纤维蛋白。根据已发表的人、爪蟾及斑马鱼角蛋白18 DNA序列,通过DNAman同源性比较获得保守序列,并从中设计二对引物。从稀有鮈鲫基因组中PCR扩增得到2 779 bp的角蛋白18的DNA序列片段;通过基因组步移,分别获得该基因的上游和下游序列片段;最后将获得的全基因片段克隆至质粒载体pMD19T进行序列测定检验。结果显示所克隆的稀有鮈鲫角蛋白18基因全长3 765 bp。对该基因进行NCBI的Blastn同源性比较分析,表明稀有鲫同斑马鱼比较角蛋白18 DNA序列存在73.6%同源相似性;同时对该基因进行生物学分析,开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)预测表明稀有鮈鲫角蛋白18是含有7个外显子和6个内含子,共编码367个氨基酸的蛋白质。

关 键 词:稀有鮈鲫  角蛋白18  克隆  基因组步移

Cloning and analysis of keratin 18 gene from fish (carp) Gobiocypris rarus
YE Ying,CAI Sheng-li and LIU Hong.Cloning and analysis of keratin 18 gene from fish (carp) Gobiocypris rarus[J].Journal of Shanghai Ocean University,2011,20(5):661-668.
Authors:YE Ying  CAI Sheng-li and LIU Hong
Abstract:
Keywords:Gobiocypris rarus  keratin 18  cloning  genome walking
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