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尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼及其杂交后代微卫星标记鉴别和种质纯度分析
引用本文:李建林,唐永凯,李红霞,俞菊华,徐跑.尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼及其杂交后代微卫星标记鉴别和种质纯度分析[J].上海海洋大学学报,2011,20(1):27-33.
作者姓名:李建林  唐永凯  李红霞  俞菊华  徐跑
作者单位:中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心, 农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室;中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心, 农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室;中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心, 农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室;中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心, 农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室;中国水产科学研究院 淡水渔业研究中心, 农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室
基金项目:公益性行业(农业)科研专项(200903046-02);基本科研业务费专项(2009JBFC02,2009JBFB05)
摘    要:从罗非鱼微卫星遗传图谱前6个连锁群上随机选取43个微卫星位点,对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、尼罗罗非鱼吉富品系(GIFT)、奥利亚罗非鱼(Oreochromis aureus)以及尼罗罗非鱼和奥利亚罗非鱼杂交后代的DNA进行PCR扩增,筛选出7个位点(UNH995GM066GM166UNH162GM017GM440UNH948)在不同罗非鱼中扩增的条带差别明显,具有特异性,可作为罗非鱼鉴定的分子标记,用其中任意一个位点都可以将尼罗罗非鱼或吉富罗非鱼、奥利亚罗非鱼、杂交罗非鱼区别开来。这7个标记位点在尼罗罗非鱼、吉富罗非鱼和奥利亚罗非鱼中平均每个位点检测到等位基因个数分别为3.1、2.3、1.7,等位基因大小在130~316 bp。这7个标记位点上,尼罗罗非鱼与奥利亚罗非鱼PCR扩增的条带大小相差在20 bp以上,对其中2个位点扩增的条带进行测序分析,结果表明是由于微卫星重复次数的差异而造成的。用这7个位点对尼罗罗非鱼、吉富罗非鱼和奥利亚罗非鱼群体的种质纯度进行检测,结果表明,这3个罗非鱼群体中分别有8%、4%、4%的个体在有些位点上的谱带与杂交罗非鱼的相似,可能存在基因污染。

关 键 词:罗非鱼  微卫星  鉴别  种质纯度

Identification and pureness of germplasm analysis of Oreochromis niloticus, Oreochromis aureus,and their hybrids by microsatellite markers
LI Jian-lin,TANG Yong-kai,LI Hong-xi,YU Ju-hua and XU Pao.Identification and pureness of germplasm analysis of Oreochromis niloticus, Oreochromis aureus,and their hybrids by microsatellite markers[J].Journal of Shanghai Ocean University,2011,20(1):27-33.
Authors:LI Jian-lin  TANG Yong-kai  LI Hong-xi  YU Ju-hua and XU Pao
Abstract:
Keywords:
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