团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析 |
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引用本文: | 马晓茜,刘至治,李思发,唐文乔,杨金权.团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析[J].上海海洋大学学报,2011,20(1):34-43. |
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作者姓名: | 马晓茜 刘至治 李思发 唐文乔 杨金权 |
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作者单位: | 上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室;上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室;上海海洋大学 农业部水产种质资源与利用重点开放实验室;上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室;上海海洋大学 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金重点项目(30630051);上海市重点学科建设项目(S30701) |
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摘 要: | 为了解团头鲂MHCⅠ类基因的结构,采用cDNA末端快速扩增(Rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次成功克隆了团头鲂“浦江I号” F0基础群体及选育F8世代的MHCⅠ类基因,共获得3条cDNA全长序列。序列全长为2 040~2 079 bp,含有87~102 bp的5′-UTR,1 035~1 044 bp的编码区(包括信号肽,alpha 1、alpha 2和alpha 3三个结构域,跨膜区和胞质区)及911~946 bp的3′-UTR区,分别编码347、344个氨基酸。F8世代序列的核苷酸/氨基酸的同源性很高,为89.0%/93.0%,而与F0世代的同源性较低(75.3%~77.0 % 和71.1%~71.4%),呈现出明显的分子多态性。分析表明,团头鲂具有经典的MHCⅠ类分子的空间结构,与人类HLA-A2的抗原肽结合区的晶体结构相比,二者的差异主要集中在5个(I~V)区上。在Neighbor-joining(NJ)法构建的分子进化树中,团头鲂与草鱼的亲缘关系最近,与鲑鳟鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类及人类的亲缘关系则渐远。RT-PCR组织表达分析表明,团头鲂MHCⅠ类基因在所检测的的8个组织中均表达,在鳃、头肾和血液中有较强的转录本,中等强度表达于肝脏和脾脏,在后肾、肠和肌肉中表达较弱。
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关 键 词: | 团头鲂 主要组织相容性复合体 cDNA 克隆 组织表达 |
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