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我国主要养殖罗非鱼的16S rRNA序列特征分析
引用本文:郭奕惠,黄桂菊,喻达辉,李莉好,符云,叶卫.我国主要养殖罗非鱼的16S rRNA序列特征分析[J].上海海洋大学学报,2007(5):490-494.
作者姓名:郭奕惠  黄桂菊  喻达辉  李莉好  符云  叶卫
作者单位:[1]中国水产科学研究院南海水产研究所,广东广州510300 [2]国家级广东罗非鱼良种场,广东广州511453
摘    要:对我国主要养殖的尼罗、奥利亚、莫桑比克、杂交种尼奥(尼罗♀×奥利亚♂)和红罗非鱼(莫桑比克×尼罗)的线粒体16S rRNA部分序列进行了PCR扩增和测序分析,探讨罗非鱼种间亲缘关系和种类鉴别标记。PCR产物经直接测序,5种罗非鱼中大部分个体均获得长546 bp的基因序列。其碱基组成GC含量为47.4%。序列比对分析显示变异位点18个,没有插入/缺失位点,转换/颠换比率为2.7。序列分析表明,红和奥利亚各有2个单倍型,尼奥、莫桑比克与尼罗各有1个单倍型。其中,尼奥与尼罗的单倍型序列相同,莫桑比克与红罗非鱼的1个单倍型序列相同。表明部分红罗非鱼的母本为莫桑比克。UPGMA聚类分析表明,尼奥与尼罗聚成一支、红罗非鱼与莫桑比克成一支、奥利亚独成一支。

关 键 词:罗非鱼  16S  rRNA基因  种类鉴定  序列特征
修稿时间:2006/11/30 0:00:00

Sequence analysis of mitochondrial 16S rRNA in Oreochromis species in China
GUO Yi-hui,HUANG Gui-ju,YU Da Hui,LI Li-hao,FU Yun,YE Wei.Sequence analysis of mitochondrial 16S rRNA in Oreochromis species in China[J].Journal of Shanghai Ocean University,2007(5):490-494.
Authors:GUO Yi-hui  HUANG Gui-ju  YU Da Hui  LI Li-hao  FU Yun  YE Wei
Institution:1. South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510300, China; 2. National Tilapia Breeding Farm of Guangdong Province, Guangzhou 511453, China
Abstract:
Keywords:Oreochromis species  16S rRNA  species identification  sequence characteristics
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