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长江口鲚属鱼类线粒体DNA控制区结构分析
引用本文:诸廷俊,杨金权,唐文乔.长江口鲚属鱼类线粒体DNA控制区结构分析[J].上海海洋大学学报,2008(2):152-157.
作者姓名:诸廷俊  杨金权  唐文乔
作者单位:[1]上海水产大学鱼类研究室,上海200090 [2]中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所,上海200025
基金项目:国家自然科学基金 , 上海市科委资助项目 , 上海市重点学科建设项目
摘    要:测定了21尾长江口鲚属鱼类mtDNA D-loop区全序列,长度在1 233~1 372 bp之间,其中凤鲚长达1 372 bp,短颌鲚为1 233 bp,刀鲚和湖鲚出现长度的异质性现象,各具有1 271 bp和1 233 bp两种类型.识别了终止序列区、中央保守区和保守区.终止序列区长650~790 bp,包含了多个重复的ETAS,结构为:TACATAT---ATGTAqTATAT.全序列21次转换中的17次和9次颠换中的7次都发生于该区.终止区还包含140个多态位点和97个系统发育信息位点,分别占整个D-loop区相应位点的80.9%和78.9%.中央保守区中的CSB-F、CSB.E、CSB-D等保守序列分别为CSB-F:ATGTAGTAAGAGACCACC,CSB-E:AGGGACAACTGTGGGGG,CSB-D:TATTCCTGGCATCTGGT,有24个多态位点和18个系统发育信息位点来自该区.在保守区识别了CSB1、CSB2和CSB3,序列为CSB1:TT-ATAGAAGA-T-ACATAA,CSB2:AAACCCCCTTACCCCC,CSB3:TGTCAAACCCCGAAA,仅有9个多态位点和8个信息位点.研究表明D-loop区的序列变异主要来自终止序列区.

关 键 词:鲚属鱼类  线粒体控制区  序列长度异质性  长江口  长江口  鲚属  鱼类  线粒体  控制区  结构分析  Yangtze  River  estuary  genus  structure  sequence  control  region  自终止  序列变异  研究  序列分  信息位  系统发育  多态位点  终止区  发生
修稿时间:2007/4/30 0:00:00

MtDNA control region sequence structure of the genus Coilia in Yangtze River estuary
ZHU Ting-jun,YANG Jin-quan,TANG Wen-qiao.MtDNA control region sequence structure of the genus Coilia in Yangtze River estuary[J].Journal of Shanghai Ocean University,2008(2):152-157.
Authors:ZHU Ting-jun  YANG Jin-quan  TANG Wen-qiao
Abstract:
Keywords:
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