秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析 |
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引用本文: | 窦妍,丁君,曲凌云,刘志敏,王轶南,穆晓虎,常亚青.秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性分析[J].大连海洋大学学报,2015(2):143-148. |
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作者姓名: | 窦妍 丁君 曲凌云 刘志敏 王轶南 穆晓虎 常亚青 |
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作者单位: | 大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室;国家海洋局第一海洋研究所 |
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基金项目: | 国家海洋局科研项目(201105007-2);辽宁省教育厅优秀人才支持计划项目(LJQ2011073) |
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摘 要: | 以黄海和渤海代表性刺参养殖池塘秋、冬季海水和沉积物基因组DNA为模板,以细菌16S r DNA通用引物进行PCR扩增,构建16S r DNA文库并进行测序分析,研究了秋、冬季刺参养殖池塘菌群的多样性。结果表明:海水和沉积物中主要包括11个门类的细菌,即变形菌门(Proteobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、脱铁杆菌门(Deferribacteres)、绿弯菌门(Chloroflexi);黄海和渤海刺参养殖池塘海水和沉积物中优势类群均为变形菌(变形菌比例48%);用Shannon指数及Simpson优势度指数分析细菌的多样性,黄、渤海刺参养殖池塘中,冬季沉积物细菌Simpson优势度指数均最低,分别为0.014 89和0.016 50,Shannon指数均最高,分别为6.312和5.695。研究表明,黄海和渤海刺参养殖池塘中,冬季沉积物细菌多样性均最高。
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关 键 词: | 刺参 养殖池塘 16S rDNA 变形菌门 |
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