光棘球海胆CYP17基因的SNPs标记筛选及遗传分析 |
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引用本文: | 朱琳琳,王秀利,王洪迪,郭晓黎,常亚青,刘洋,仇雪梅.光棘球海胆CYP17基因的SNPs标记筛选及遗传分析[J].大连海洋大学学报,2013(4):373-377. |
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作者姓名: | 朱琳琳 王秀利 王洪迪 郭晓黎 常亚青 刘洋 仇雪梅 |
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作者单位: | 大连海洋大学 农业部北方海水增养殖重点实验室;大连海洋大学水产与生命学院 |
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基金项目: | 国家“863”计划重大项目(2012AA10A412);国家自然科学基金资助项目(31101923);辽宁省自然科学基金资助项目(20102043);辽宁省百千万人才工程项目(2010921093);大连海洋大学科研项目(2012HYDX02) |
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摘 要: | 采用聚合酶链式反应、单链构象多态性(PCR-SSCP)技术和基因测序方法筛选光棘球海胆Strongylocentrotus nudus细胞色素17α羟化酶/17,20裂解酶(17α-hydroxylase/17,20-lyase,CYP17)基因编码区单核苷酸多态性(SNPs),并进行了基于SNPs的遗传分析。结果表明:在CYP17基因的270、417、666 nt处均发生了碱基的点突变,即G270A、A417G和C666T,前两个突变位点位于引物对BF/BR的扩增产物中,后一个突变位点位于引物对CF/CR的扩增产物中;引物对BF/BR的扩增产物可形成3种基因型,即AA、BB和AB基因型,A和B等位基因频率分别为0.54和0.46,AA、AB和BB基因型频率分别为0.30、0.48和0.22,该座位的杂合度(He)、纯合度(Ho)、多态性信息含量(PIC)和有效等位基因数(Na)分别为0.496 8、0.503 2、0.373 4和1.987 3;引物对CF/CR的扩增产物形成了两种基因型,即CC和CD基因型,C和D等位基因频率分别为0.68和0.32,CC和CD基因型频率分别为0.84和0.16,该座位的He、Ho、PIC和Na分别为0.268 8、0.731 2、0.232 7和1.367 6。遗传变异分析结果表明:两个座位均属于低度多态性,而且群体遗传杂合度较低,这反映了该群体的遗传一致性较高。本研究筛选的3个SNPs为今后CYP17基因在光棘球海胆性腺生长发育研究上提供了前期科研基础。
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关 键 词: | 光棘球海胆 CYP17基因 单核苷酸多态性 遗传分析 |
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