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基于线粒体16S rRNA基因序列的中日朝菲律宾蛤仔野生群体遗传多样性分析
引用本文:谭月,邱明,李金龙,左陆雅,吴婉婷,霍忠明,闫喜武.基于线粒体16S rRNA基因序列的中日朝菲律宾蛤仔野生群体遗传多样性分析[J].大连海洋大学学报,2021,36(1):127-134.
作者姓名:谭月  邱明  李金龙  左陆雅  吴婉婷  霍忠明  闫喜武
作者单位:大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023;大连海洋大学水产与生命学院,辽宁大连116023;辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心,辽宁大连116023
基金项目:辽宁省"兴辽英才计划"项目;国家贝类产业技术体系专项;国家重点研发计划项目;大连市支持高层次人才创新创业项目;辽宁省高等学校海洋产业技术研究院项目
摘    要:为了解中国菲律宾蛤仔Ruditapes philippinarum野生苗种产区的群体和潜在可作修复用途的日本、朝鲜群体的种质遗传基础,以中国山东莱州(LZ)、广西北海(BH)、辽宁营口(YK)、天津(TJ)4个野生群体,以及日本北海道(JH)和朝鲜新义州(NKS)野生群体(各10个)为材料,通过线粒体16SrRNA基因片段扩增测序,比较了各群体的遗传结构和遗传多样性.结果表明:菲律宾蛤仔16S rRNA序列扩增片段为535 bp,基因片段的T、C、A、G含量分别为33.3%、10.9%、33.8%和22.0%,A+T含量为67.1%,60个个体共确定了20个单倍型,不同个体间存在单倍型共享现象;6个群体的单倍型多样性(Hd)为0.378~0.911,核苷酸多样性(Pi)为0.000 75~0.010 60,核苷酸差异数(K)为0.400~5.578;菲律宾蛤仔中国天津、营口、莱州及北海4个群体具有较丰富的遗传多样性,朝鲜新义州和日本北海道群体遗传多样性(Hd<0.5,Pi<0.005)较低.研究表明,中日朝菲律宾蛤仔野生群体可划分为南、北方谱系,即北海群体为南方谱系,其他5个群体为北方谱系,中国北方的3个群体(营口、天津和莱州)及日本、朝鲜群体间存在距离隔离模式基因流,中国人工异地移养菲律宾蛤仔活动对本地野生群体基因资源产生一定影响,本研究结果可为菲律宾蛤仔种质资源保护和可持续利用提供参考.

关 键 词:菲律宾蛤仔  线粒体16S  rRNA  遗传多样性  遗传分化

Genetic diversity analysis of wild populations of Manila clam Ruditapes philippinarum from China,Japan and Democratic People's Republic of Korea based on mitochondrial 16S rRNA gene sequence
Authors:TAN Yue  QIU Ming  LI Jinlong  ZUO Luya  WU Wanting  HUO Zhongming  YAN Xiwu
Abstract:
Keywords:
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