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湿地松左旋β-蒎烯合成酶基因PeTPS-(-)BPin的同源克隆及生物信息学分析
引用本文:雷蕾,潘显强,张露,黄少伟,赵衡,易敏,赖猛.湿地松左旋β-蒎烯合成酶基因PeTPS-(-)BPin的同源克隆及生物信息学分析[J].江西农业大学学报,2015(2):205-211.
作者姓名:雷蕾  潘显强  张露  黄少伟  赵衡  易敏  赖猛
作者单位:1. 江西农业大学 林学院,江西 南昌,330045
2. 江西农业大学 林学院,江西 南昌 330045; 南昌市林业局,江西 南昌 330000
3. 华南农业大学 林学院,广东 广州 510642; 广东省森林植物种质创新与利用重点实验室,广东 广州 510642
基金项目:江西省林业厅林业科技创新专项,广东省森林种质创新与利用重点实验室开放基金,中央财政林业科技推广示范资金项目
摘    要:通过火炬松等松属树种的c DNA序列同源克隆了湿地松的左旋β-蒎烯合成酶基因(Pe TPS-(-)BPin),分析表明该基因与其他松属植物之间的同源性在90%以上,与松科其他属植物之间的同源性在80%以上。裸子植物不同萜烯合成酶基因(TPS)之间的同源性在70%以上。被子植物与裸子植物的TPS基因亲缘关系较远。左旋β-蒎烯合成酶的蛋白质分子式为C3197H4972N862O957S32,分子量为71.74 ku,带弱正电,为不稳定蛋白,易分解,含37个磷酸化位点,定位在叶绿体。蛋白质二级结构含有4个不规则卷曲,24个α-螺旋,三级结构中含有一个cd00684保守域。ELM中找到7个可能的功能域,包括一个NDR切割位点、两个磷酸肽配体、一个PDZ配体、一个SH2配体、两个磷酸化位点。在68、69位存在一个RR保守结构,猜测能够在第二个R的N末端断裂并与底物结合,从而参与底物异构化。在380~384位出现了DDxx D保守域,但未能在该区搜到可能的功能位点。预测的两个磷酸化位点位于302、623位氨基酸。

关 键 词:湿地松  萜烯合成酶  同源克隆  β-蒎烯

An Analysis of Cloning and Bioinformatics of Sinistral Beta Pinene Synthetase Gene PeTPS-(-) BPin in Pinus elliottii
LEI Lei,PAN Xianqiang,ZHANG Lu,HUANG Shaowei,ZHAO Heng,YI Min,LAI Meng.An Analysis of Cloning and Bioinformatics of Sinistral Beta Pinene Synthetase Gene PeTPS-(-) BPin in Pinus elliottii[J].Acta Agriculturae Universitis Jiangxiensis,2015(2):205-211.
Authors:LEI Lei  PAN Xianqiang  ZHANG Lu  HUANG Shaowei  ZHAO Heng  YI Min  LAI Meng
Institution:LEI Lei;PAN Xian-qiang;ZHANG Lu;HUANG Shao-wei;ZHAO Heng;YI Min;LAI Meng;College of forestry,JAU;Nanchang Forestry Bureau;College of forestry,SCAU;Key laboratory of forest plant germplasm innovation and utilization;
Abstract:
Keywords:Pinus elliottii  terpene synthases  homology cloning  β-pinene
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