利用5'LongSAGE标签分析蜜蜂肌球蛋白调节性轻链基因MLC-2选择性转录起始位点 |
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引用本文: | 周沫玲,孙亮先,陈培山,谢宪兵,黄周英,倪辉.利用5'LongSAGE标签分析蜜蜂肌球蛋白调节性轻链基因MLC-2选择性转录起始位点[J].江西农业大学学报,2010,32(1). |
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作者姓名: | 周沫玲 孙亮先 陈培山 谢宪兵 黄周英 倪辉 |
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作者单位: | 1. 集美大学,生物工程学院,福建,厦门,361021;泉州师范学院,福建,泉州,362000 2. 泉州师范学院,福建,泉州,362000 3. 集美大学,生物工程学院,福建,厦门,361021 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(30300183);;福建省教育厅省属高校项目(2008F5051) |
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摘 要: | 使用西方蜜蜂雄蜂头部5’LongSAGE文库中的肌球蛋白调节性轻链基因MLC-2的标签序列,在蜜蜂全基因组序列上定位了该基因的转录起始位点(TSS),并进而预测了其启动子的结构。结果显示:蜜蜂MLC-2基因存在17个TSS,其中16个定位于MLC-2基因开放阅读框上游100bp的范围内。MLC-2基因的各TSS的使用效率不同,其中有3个优势TSS,由之起始的转录本分别占该基因总转录本数量的9.76%、54.47%和11.38%。从碱基组成来看,蜜蜂MLC-2基因TSS的第1个碱基为A、G、T、C的概率分别为58.8%、29.4%、0和11.8%。MLC-2基因的启动子结构预测结果表明,在TSS上游的300bp区域内有3个核心启动子元件。研究结果对研究蜜蜂MLC-2基因的表达调控与确定其全长cDNA序列具有重要意义。
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关 键 词: | 5’LongSAGE 标签 MLC-2基因 西方蜜蜂 转录起始位点 启动子 |
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