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PPAR-γ基因对脂质代谢调控机制的生物信息学分析
引用本文:户国,王守志,李辉.PPAR-γ基因对脂质代谢调控机制的生物信息学分析[J].东北农业大学学报,2009,40(12).
作者姓名:户国  王守志  李辉
作者单位:东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030
基金项目:国家重点基础研究发展计划(973),黑龙江省自然科学基金重点项目,国家863项目课题 
摘    要:过氧化物酶体增殖激活受体γ(PPAR-γ)是具有重要生物学功能的转录因子,可调控脂肪细胞分泌的多种蛋白质因子基因的表达,促进脂肪细胞分化。它与肥胖、Ⅱ型糖尿病、心血管疾病、癌症的发病风险相关联。研究基于TRANSFAC数据库信息,利用MEME/MAST方法对PPAR-γ进行全基因组范围的靶基因生物信息学定位,并对获得的靶基因进行了GO和KEGG分析,探讨PPAR-γ基因对脂质代谢影响的分子机理。结果表明,PPAR-γ靶基因显著富集于36个GO节点(P<0.05),并参与了10个KEGG代谢通路(P<0.05),这其中大部分GO节点和KEGG代谢通路与脂质代谢密切相关。研究有助于理解PPAR-γ基因对脂质代谢影响的分子机理;同时,对于肥胖和糖尿病等复杂疾病的诊断、预防和治疗具有积极意义。

关 键 词:PPAR-γ  脂质代谢  靶基因  生物信息学

Analysis of influence of peroxisome proliferator-activated receptor-γ gene on lipid metabolism by using bioinformatics tools
HU Guo,WANG Shouzhi,LI Hui.Analysis of influence of peroxisome proliferator-activated receptor-γ gene on lipid metabolism by using bioinformatics tools[J].Journal of Northeast Agricultural University,2009,40(12).
Authors:HU Guo  WANG Shouzhi  LI Hui
Abstract:
Keywords:lipid metabolism  target gene  bioinformatics
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