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水稻白叶枯病菌糖基化岛GI基因的分子鉴定
引用本文:孙艳伟,文景芝,吴茂森,陈华民,何晨阳.水稻白叶枯病菌糖基化岛GI基因的分子鉴定[J].东北农业大学学报,2009,40(8).
作者姓名:孙艳伟  文景芝  吴茂森  陈华民  何晨阳
作者单位:1. 东北农业大学农学院,哈尔滨,150030;中国农业科学院植物保护研究所,植物病虫害生物学国家重点实验室,北京,100193
2. 东北农业大学农学院,哈尔滨,150030
3. 中国农业科学院植物保护研究所,植物病虫害生物学国家重点实验室,北京,100193
基金项目:中央财政国家重点实验室自主研究课题专项 
摘    要:为了阐述水稻白叶枯病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)糖基化岛(Glycosylation Island,GI)基因的结构特征以及可能的生物学功能,研究通过基因克隆和序列分析,对GI基因结构特征进行了鉴定;通过与铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,Pa)a型短GI基因的比较,对XooGI基因进行了功能推测分析。用特异性引物进行PCR扩增,从野生型菌株PXO99A基因组中克隆了10个GI基因序列。该GI插在鞭毛基因簇中,上游为转录调控因子基因fleQxoo,下游为鞭毛基体蛋白基因fliExoo。GI基因均为单拷贝,转录方向相同。GI基因核苷酸序列在Xoo和Paa型短岛中同源性达41.98%~78.58%,其中糖基转移酶基因rbfC具有保守结构域(Glycos_transf_2),在病原黄单胞中同源性较高。在GI基因启动子中存在σ54保守结合序列GG-(N10)-GC和转录调控因子FleQxoo结合序列CC-(N4)-C-(N4)-T。因此,XooGI可能具有进化上的结构和功能保守性;其基因转录可能受到σ54和FleQxoo的直接调控。

关 键 词:水稻白叶枯病菌  糖基化岛  基因克隆  结构特征  糖基转移酶

Molecular identification and homology analysis of genes clustered in a genomic glycosylation island of Xanthomonas oryzae pv.oryzae.
SUN Yanwei,WEN Jingzhi,WU Maosen,CHEN Huamin,HE Chenyang.Molecular identification and homology analysis of genes clustered in a genomic glycosylation island of Xanthomonas oryzae pv.oryzae.[J].Journal of Northeast Agricultural University,2009,40(8).
Authors:SUN Yanwei  WEN Jingzhi  WU Maosen  CHEN Huamin  HE Chenyang
Institution:SUN Yanwei1,2,WEN Jingzhi1,WU Maosen2,CHEN Huamin2,HE Chenyang2 (1. College of Agriculture,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China,2. State Key Laboratory for Biology of Plant Diseases , Insect Pests,Institute of Plant Protection,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100193,China)
Abstract:
Keywords:Xanthomonas oryzae pv  oryzae  glycosylation island  gene cloning  molecular characterization  glycosyl-transferase  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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