| 利用全基因组关联分析挖掘粳稻直链淀粉含量调控基因 |
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| 引用本文： | 郑洪亮,孙世臣,丁国华,王彤彤,赵宏伟,王敬国,刘化龙,韩笑,邹德堂,来永才.利用全基因组关联分析挖掘粳稻直链淀粉含量调控基因[J].东北农业大学学报,2021,52(10):21-31. |
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| 作者姓名： | 郑洪亮 孙世臣 丁国华 王彤彤 赵宏伟 王敬国 刘化龙 韩笑 邹德堂 来永才 |
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| 作者单位： | 黑龙江省农业科学院博士后科研工作站,哈尔滨 150086;东北农业大学寒地粮食作物种质创新与生理生态教育部重点实验室,哈尔滨 150030;黑龙江省农业科学院博士后科研工作站,哈尔滨 150086;东北农业大学寒地粮食作物种质创新与生理生态教育部重点实验室,哈尔滨 150030;黑龙江省农业科学院,哈尔滨 150086 |
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| 摘 要： | 直链淀粉含量是评价稻米蒸煮食味品质关键指标,挖掘控制该性状QTLs/基因对于改良稻米品质具有重要意义.研究利用295份粳稻种质组成的自然群体为试验材料,测定2019年和2020年稻米直链淀粉含量,结合重测序得到788 396个高质量SNP,利用Tassel 5.0软件混合线性模型(MLM,Q+K)作全基因组关联分析.结果表明,两年共检测到12个与稻米直链淀粉含量相关QTL,分布在水稻第3、4、11和12染色体上,贡献率范围为8.78％～11.62％,其中qAAC4-2和qAAC12-2在两年中重复检测到.进一步针对这两个QTL区间内所有基因作单倍型分析,结合基因注释和前人研究结果,推测LOC_Os04g33640为影响稻米直链淀粉含量新候选基因.
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| 关 键 词： | 粳稻 直链淀粉含量 GWAS 候选基因 |
Identification of regulation genes influencing amylose content in japonica rice using genome-wide association analysis |
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| ZHENG Hongliang,SUN Shichen,DING Guohua,WANG Tongtong,ZHAO Hongwei,WANG Jingguo,LIU Hualong,HAN Xiao,ZOU Detang,LAI Yongcai.Identification of regulation genes influencing amylose content in japonica rice using genome-wide association analysis[J].Journal of Northeast Agricultural University,2021,52(10):21-31. |
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| Authors: | ZHENG Hongliang SUN Shichen DING Guohua WANG Tongtong ZHAO Hongwei WANG Jingguo LIU Hualong HAN Xiao ZOU Detang LAI Yongcai |
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