|
|||||
|
|
| 大豆SBP基因家族的序列特征、表达及进化分析 | |
| 引用本文： | 朱红霞,胡利宗,邓小莉,蔺芳.大豆SBP基因家族的序列特征、表达及进化分析[J].东北农业大学学报,2012(7):26-33. |
| 作者姓名： | 朱红霞 胡利宗 邓小莉 蔺芳 |
| 作者单位： | 1. 新乡学院生命科学与技术系,河南新乡453003 2. 中国科学院遗传发育所,北京100101 3. 中国科学院研究生院,北京100039 |
| 基金项目： | 河南省政府决策研究招标课题(B578) |
| 摘 要： | SBP基因家族是植物所特有的一类重要转录因子,由多个成员组成,主要参与植物生长、发育以及多种生理生化过程.试验在大豆基因组中鉴定49个SBP基因,被命名为GmSBP1~49.基于生物信息学手段,对大豆该基因家族49个成员的基因结构、染色体定位、蛋白保守序列、亚细胞定位、表达情况及进化关系进行分析.序列分析表明,SBP基因家族成员分散于不同染色体上,不同基因具有不同个数的外显子,其数目变异范围为1~14;该家族蛋白含有5个保守基序,尽管与SBP结构域有所重叠,但它们能形成6种不同的组织模式,这说明该基因家族序列变异较为复杂.表达分析结果显示,除GmSBP2和GmSBP11等6个基因没有相应的EST外,其余基因都有转录活性;在具有转录活性的基因中,只有GmSBP46显示出组成型表达模式,剩余基因表现出不同程度的组织特异性表达模式.拟南芥、水稻和大豆SBP蛋白的进化树揭示该家族具有8个类群,其中E类群只包括大豆SBP基因,其他类群中大豆SBP基因数目也是最多,这充分说明大豆SBP基因家族起源与进化的复杂性.研究为大豆SBP基因功能研究提供线索 |
| 关 键 词： | 大豆 结构域 基因家族 进化 |
Sequence characterization,expression pattern,and evolutionary analysis of SBP-domain gene family in soybean(Glycine max) |
|
| ZHU Hongxia,HU Lizong,DENG Xiaoli,LIN Fang.Sequence characterization,expression pattern,and evolutionary analysis of SBP-domain gene family in soybean(Glycine max)[J].Journal of Northeast Agricultural University,2012(7):26-33. | |
| Authors: | ZHU Hongxia HU Lizong DENG Xiaoli LIN Fang |
| Institution: | 1(1.Department of Life Sciences and Technology,Xinxiang College,Xinxiang Henan 453003,China;2.Institute of Genetics and Developmental Biology,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100101,China;3.School of Graduate,Chinese Academy of Sciences,Beijing 100039,China) |
| Abstract: | |
| Keywords: | soybean domain gene family evolution |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ | |