黄瓜幼果cDNA文库构建与EST测序分析 |
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引用本文: | 潘宇,蒲志群,肖雅文,赵名琛,郑浴,石士涛,胡小燕,张兴国.黄瓜幼果cDNA文库构建与EST测序分析[J].西南大学学报,2013,35(6). |
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作者姓名: | 潘宇 蒲志群 肖雅文 赵名琛 郑浴 石士涛 胡小燕 张兴国 |
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作者单位: | 南方山地园艺学教育部重点实验室,西南大学园艺园林学院,重庆400716 |
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基金项目: | 重庆市科委重大攻关项目(CSTC2010AA1019)基金 |
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摘 要: | 将黄瓜授粉前后多个发育阶段的幼果组织等量混合后提取总RNA和mRNA,以λTriplEx2为栽体、XL1-Blue为宿主茵,构建了1个黄瓜幼果cDNA文库;其滴度为1.165×106pfu/mL,重组率在94.4%左右.测序获得116条EST,92.2%的长度在400 bp以上,19%为重叠序列.在GenBank中进行BLAST分析后确认与已知功能基因相似的EST序列有71条,有相似序列而功能未知的基因和没有相似序列的EST序列各占19.83%和18.97%.从对文库的检验结果看,构建的cDNA文库重组率较高,库容达到预期要求.
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关 键 词: | 黄瓜 幼果cDNA文库 表达序列标签(EST) |
Construction of a Young Fruit cDNA Library and EST Sequencing in Cucumis sativus |
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Abstract: | |
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Keywords: | cucumber cDNA library of young fruit ESTs (expressed sequence tags) |
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