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黄瓜幼果cDNA文库构建与EST测序分析
引用本文:潘宇,蒲志群,肖雅文,赵名琛,郑浴,石士涛,胡小燕,张兴国.黄瓜幼果cDNA文库构建与EST测序分析[J].西南大学学报,2013,35(6).
作者姓名:潘宇  蒲志群  肖雅文  赵名琛  郑浴  石士涛  胡小燕  张兴国
作者单位:南方山地园艺学教育部重点实验室,西南大学园艺园林学院,重庆400716
基金项目:重庆市科委重大攻关项目(CSTC2010AA1019)基金
摘    要:将黄瓜授粉前后多个发育阶段的幼果组织等量混合后提取总RNA和mRNA,以λTriplEx2为栽体、XL1-Blue为宿主茵,构建了1个黄瓜幼果cDNA文库;其滴度为1.165×106pfu/mL,重组率在94.4%左右.测序获得116条EST,92.2%的长度在400 bp以上,19%为重叠序列.在GenBank中进行BLAST分析后确认与已知功能基因相似的EST序列有71条,有相似序列而功能未知的基因和没有相似序列的EST序列各占19.83%和18.97%.从对文库的检验结果看,构建的cDNA文库重组率较高,库容达到预期要求.

关 键 词:黄瓜  幼果cDNA文库  表达序列标签(EST)

Construction of a Young Fruit cDNA Library and EST Sequencing in Cucumis sativus
Abstract:
Keywords:cucumber  cDNA library of young fruit  ESTs (expressed sequence tags)
本文献已被 万方数据 等数据库收录!
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