| 大豆抗逆相关基因GmERF10克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 薄晓雪,吴楠,王楠,孟祥鹏,曲静,刘思言,王丕武.大豆抗逆相关基因GmERF10克隆及生物信息学分析[J].吉林农业大学学报,2021,43(5):524-529. |
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| 作者姓名： | 薄晓雪 吴楠 王楠 孟祥鹏 曲静 刘思言 王丕武 |
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| 作者单位： | 吉林农业大学农学院,长春130118 |
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| 摘 要： | 为分离克隆大豆抗旱功能重要基因,前期运用RNA-Seq技术对M18苗期根系转录组进行了分析,筛选与苗期大豆根系生长发育相关的显著差异表达基因,选取差异较大的基因进行克隆,提取M18叶片基因组,设计引物,得到目标片段,命名为GmERF10.为了解GmERF10的结构和功能特点,利用生物信息学工具和软件对GmERF10的理化性质和蛋白质结构等进行了系统分析,并探讨了同物种及不同物种间乙烯应答转录因子(ERF)基因的亲缘关系.结果表明:GmERF10为不具有信号肽和跨膜结构域的亲水性蛋白.GmERF10含有38个潜在磷酸化位点.GmERF10蛋白的二级结构主要以α-螺旋、β-折叠和无规则卷曲组成.GmERF10亚细胞主要定位于细胞核中,结构域为AP2/ERF结构域,预测其功能为乙烯应答转录因子(ERF),主要通过结合GCC顺式作用元件来调节抗性基因的表达.
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| 关 键 词： | 大豆 ERF GmERF10 克隆 生物信息学 功能预测 |
Cloning and Bioinformatics of Resistance Related Gene GmERF10 in Soybean |
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| BO Xiaoxue,WU Nan,WANG Nan,MENG Xiangpeng,QU Jing,LIU Siyan,WANG Piwu.Cloning and Bioinformatics of Resistance Related Gene GmERF10 in Soybean[J].Journal of Jilin Agricultural University,2021,43(5):524-529. |
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| Authors: | BO Xiaoxue WU Nan WANG Nan MENG Xiangpeng QU Jing LIU Siyan WANG Piwu |
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