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水稻Osrdr1突变体全基因组CCGG位点甲基化的研究
引用本文:王宁宁,王慧,陈亮,李过,门秋影.水稻Osrdr1突变体全基因组CCGG位点甲基化的研究[J].吉林农业大学学报,2014(6).
作者姓名:王宁宁  王慧  陈亮  李过  门秋影
作者单位:1. 吉林农业大学农学院,长春,130118
2. 莱芜市第一中学,莱芜,271100
3. 吉林农业大学农学院,长春130118; 长春市第十七中学,长春130021
基金项目:吉林省科技发展计划项目,吉林农业大学博士启动基金项目
摘    要:DNA胞嘧啶甲基化变异调控植物基因组内功能基因表达和转座子转座活性,影响植物生长和发育的稳定性。RNA-dependent RNA polymerase 2(RDR2)基因参与RNA-directed DNA methylation(RdDM)途径指导合成CHH(H=G、T、A)甲基化,CHH甲基化在基因和转座子上表现不同,是目前DNA胞嘧啶甲基化的研究热点之一。拟南芥中RDR1基因与RDR2属于同一家族,最新研究结果证实,RDR1基因不仅可以指导CHH甲基化形成,并且其功能缺失会不同程度影响CG和CHG甲基化。前期研究工作表明,水稻中其同源基因OsRDR1功能缺失可在特异位点影响DNA胞嘧啶甲基化,但是否大规模影响全基因组DNA甲基化尚不明确。在此基础上,采用甲基化敏感多态性扩增(Methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)技术研究OsRDR1基因功能缺失突变体全基因组CCGG位点的甲基化情况。结果同野生型比较分析发现,OsRDR1基因功能缺失没有引起全基因组CCGG位点甲基化水平的显著变化,但一定程度产生CHG去甲基化变异。由于MSAP试验方法的局限性,关于Osrdr1突变体全基因组DNA胞嘧啶甲基化变异还需更深入研究论证。

关 键 词:OsRDR1基因  DNA胞嘧啶甲基化  水稻

Methylation of Genome-wide CCGG Sites of Osrdr1 Mutant in Rice
WANG Ningning,WANG Hui,CHEN Liang,LI Guo,MEN Qiuying.Methylation of Genome-wide CCGG Sites of Osrdr1 Mutant in Rice[J].Journal of Jilin Agricultural University,2014(6).
Authors:WANG Ningning  WANG Hui  CHEN Liang  LI Guo  MEN Qiuying
Abstract:
Keywords:OsRDR1 gene  DNA cytosine methylation  rice
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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