| 空肠弯曲菌flaA基因序列及功能预测分析 |
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| 引用本文： | 訾臣,曾德新,蒋鲁岩,袁飞,蒋原,薛峰.空肠弯曲菌flaA基因序列及功能预测分析[J].安徽农业科学,2017,45(32):156-160,183. |
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| 作者姓名： | 訾臣 曾德新 蒋鲁岩 袁飞 蒋原 薛峰 |
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| 作者单位： | 江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心,江苏南京210019;南京农业大学动物医学院,江苏南京210095;江苏出入境检验检疫局动植物与食品检测中心,江苏南京,210019;中国检验检疫科学研究院,北京,100025;上海出入境检验检疫局,上海,200135;南京农业大学动物医学院,江苏南京,210095 |
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| 基金项目： | 国家质量监督检验检疫总局科技计划项目，江苏省出入境检验检疫局科研项目，南京农业大学科研资助项目，质检公益性行业科研专项 |
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| 摘 要： | 目的]对空肠弯曲菌空肠弯曲菌flaA基因的序列及功能进行预测分析。方法]分析了多个空肠弯曲菌flaA核酸及氨基酸序列组成和序列差异性;预测分析了flaA基因密码子使用偏好性、蛋白结构和功能域、Fla A与相关功能蛋白的互作情况。结果]不同菌株的flaA基因序列存在差异性,且差异主要存在于序列的中间区域。不同空肠弯曲菌菌株的同一基因在密码子选择上存在差异。Fla A与多个蛋白存在不同形式的相互作用。结论]该研究可为空肠弯曲菌flaA基因序列分析和功能研究应用提供基础和依据。
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| 关 键 词： | 空肠弯曲菌 flaA基因 密码子偏好 蛋白结构域 蛋白互作 |
Analysis of Gene Sequence and Function Prediction of flaA in Campylobacter jejuni |
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| Abstract: | Objective] To analyze and predict gene sequence and function of flaA in Campylobacter jejuni.Method] The composition and variation of multiple nucleotide sequences and amino acid sequences of flaA were analyzed.The analyses of codon preference,protein structure and function domains,and protein-protein interactions were performed.Result] Gene sequence offlaA of different strains existed difference,the difference mainly existed in the intermediate region of the sequence.There were differences in codon choice on the same gene of different C.jejuni strains.FlaA interacted with multiple proteins in different forms.Conclusion]The study provides the basis and foundation for the flaA gene analysis and function research of C.jejuni. |
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| Keywords: | Campylobacter jejuni flaA gene Codon preference Protein domain Protein interaction |
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