| 紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶mPDI的生物信息学分析与同源建模 |
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| 引用本文： | 王海波,施晓东,张梅芬,郭俊云.紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶mPDI的生物信息学分析与同源建模[J].安徽农业科学,2009,37(33):16263-16267. |
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| 作者姓名： | 王海波 施晓东 张梅芬 郭俊云 |
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| 作者单位： | 曲靖师范学院生物资源与环境科学学院,云南曲靖,655011;曲靖师范学院生物资源与环境科学学院,云南曲靖,655011;曲靖师范学院生物资源与环境科学学院,云南曲靖,655011;曲靖师范学院生物资源与环境科学学院,云南曲靖,655011 |
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| 基金项目： | 曲靖师范学院校内青年科研基金项目 |
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| 摘 要： | 紫花苜蓿蛋白质二硫键异构酶的基因已经被克隆测序。利用其mRNA及氨基酸序列，应用生物信息学软件预测了该蛋白质的理化性质、亲/疏水性、信号肽、二级结构、卷曲螺旋结构、跨膜区域、糖基化位点、活性位点、亚细胞定位、功能结构域及高级结构。结果表明，该蛋白质是一个整体疏水性蛋白，细胞定位为粗面内质网，含有512个氨基酸，理论等电点为4.98，信号肽位于1～24号氨基酸；二级结构中α-螺旋占26.37％（135AA），无规则卷曲占53.32％（273AA），延伸链占20.31％（104AA）；包含3个卷曲螺旋结构，3个糖基化位点，2个硫氧还蛋白结构域，2个硫氧还蛋白活性位点。Ramachandram结构检测表明此模型的三维结构符合立体化学能量规则。
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| 关 键 词： | 紫花苜蓿 蛋白质二硫键异构酶 同源建模 |
Bioinformatics Analysis and Homology Modeling Study of Protein Disulfide Isomerase (mPDI) from Medicago sativa L. |
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| WANG Hai-bo et al.Bioinformatics Analysis and Homology Modeling Study of Protein Disulfide Isomerase (mPDI) from Medicago sativa L.[J].Journal of Anhui Agricultural Sciences,2009,37(33):16263-16267. |
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| Authors: | WANG Hai-bo |
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| Institution: | WANG Hai-bo et al(College of Biological resource , Environmental science,Qujing Normal University,Qujing,Yunnan 655011) |
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| Abstract: | pai gene from Medicago soctiva L.encoding Protein Disulfide Isomerase(mPDI)has been cloned and sequenced.According to the mRNA and amino acid sequence,the character of mPDI such as the physical and chemical properties,hydrophilicity/hydrophobicity,signal peptide,secondary structure,coiled coil,transmembrane domains,O-glycogylation site,active site,subcellular localization,functional structural domains and three-dimensional structure were analyzed by a series of bioinformatics software.The results showed tha... |
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| Keywords: | Medicago sativa L Protein disulfide isomerase Homology modeling |
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