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河豚4SNc-Tudor蛋白的鉴定及生物信息分析
引用本文:徐庆刚,陆健,郑建洲,陈华友,陈克平.河豚4SNc-Tudor蛋白的鉴定及生物信息分析[J].安徽农业科学,2010,38(3):1163-1166.
作者姓名:徐庆刚  陆健  郑建洲  陈华友  陈克平
作者单位:江苏大学生命科学研究院,江苏镇江,212013;江苏大学生命科学研究院,江苏镇江,212013;江苏大学生命科学研究院,江苏镇江,212013;江苏大学生命科学研究院,江苏镇江,212013;江苏大学生命科学研究院,江苏镇江,212013
基金项目:江苏省高校自然科学基金项目(08KJD180008)
摘    要:[目的]对河豚4SNc Tudor蛋白(SN4TDR)进行序列与结构相关的生物信息分析,为认识该蛋白结构与功能提供借鉴。[方法]应用双向电泳及基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱(MALDI TOF MS)技术,从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc Tudor结构域蛋白。并对其进行生物信息学分析。[结果]首次从河豚肝脏总蛋白中鉴定到河豚的4SNc Tudor结构域蛋白SN4TDR。河豚SN4TDR定位于细胞质,无信号肽,为非分泌蛋白,有多个磷酸化位点。蛋白SN4TDR存在α 螺旋、β 折叠和无规则卷曲结构,有一个可能形成跨膜结构的片段。并用同源建模的方法,预测了河豚SN4TDR的三维结构模型。[结论]分析河豚SN4TDR基因及蛋白结构,有助于进一步研究该蛋白及其基因的分子和生物学功能。

关 键 词:河豚  MALDI-TOFMS  4SNc-Tudor  生物信息学

Characterization and Bioinformatics Analysis of 4SNc-Tudor Domain Protein of Takifugu rubripes
XU Qing-gang et al.Characterization and Bioinformatics Analysis of 4SNc-Tudor Domain Protein of Takifugu rubripes[J].Journal of Anhui Agricultural Sciences,2010,38(3):1163-1166.
Authors:XU Qing-gang
Institution:Institute of Life Science;Jiangsu University;Zhenjiang;Jiangsu 212013
Abstract:Objective]To provide a structural and functional bioinformatics analysis of 4SNc-Tudor domain protein(SN4TDR) in Takifugu rubripes,which can be refered to subsequently.Methods]Two-dimensional gel electrophoresis(2-DE) and matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry(MALDI-TOF MS) were used to identify the SN4TDR protein from T.rubripes liver.Various methods were used in bioinformatics analysis.Results]The SN4TDR protein was first identified in T.rubripes.And it's a non-sec...
Keywords:Takifugu rubripes  MALDI-TOF MS  4SNc-Tudor  Bioinformatics  
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