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亚东鲑线粒体COⅠ与COⅡ基因遗传多样性分析
引用本文:李福贵,邹曙明.亚东鲑线粒体COⅠ与COⅡ基因遗传多样性分析[J].安徽农业科学,2014(23).
作者姓名:李福贵  邹曙明
作者单位:上海海洋大学水产与生命学院农业部淡水水产种质资源重点实验室,上海,201306;上海海洋大学水产与生命学院农业部淡水水产种质资源重点实验室,上海,201306
基金项目:农业部公益性行业(农业)科研专项(201203086);国家自然科学基金项目(31272633,31201760);上海高校知识服务平台(ZF1206)
摘    要:目的]分析亚东鲑线粒体COⅠ与COⅡ基因遗传多样性。方法]分别从西藏亚东河与亚东鲑养殖站采集野生与养殖亚东鲑各15尾样品,对其线粒体DNA COⅠ、COⅡ基因全序列进行PCR扩增、测序比对。结果]序列长度分别为631、634 bp。序列分析结果显示:30条亚东鲑线粒体DNA COⅠ、COⅡ序列分别检测到1种、3种单倍型,均无碱基插入、缺失,COⅡ序列有2个位点出现碱基替换;COⅠ、COⅡ序列T、C、A和G碱基平均含量分别为29.5%、28.97%,30.6%、28.47%,22.5%、27.03%和17.4%、15.53%,其中A+T的含量(52.0%、56.0%)均显著高于G+C含量(48.0%、44.0%),均表现出明显的碱基偏倚;COⅠ、COⅡ单倍型多态性(h)与核苷酸多态性(π)值分别为0、0.80与0、0.000 1;根据Kimura双参数模型构建基于线粒体COⅠ、COⅡ序列的系统进化树,两亚东鲑鱼遗传距离分别为0、0.002 4。结论]西藏亚东鲑的遗传多样性水平较低,且养殖和野生群体无遗传分化。

关 键 词:亚东鲑  COⅠ基因  COⅡ基因  序列特征  遗传机制  遗传分化
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