酉州乌羊皮肤组织ASIP基因的RACE克隆及分析

【目的】研究酉州乌羊皮肤组织ASIP基因及其编码蛋白的结构和功能。【方法】采用RACE技术对酉州乌羊皮肤组织进行扩增,获得了酉州乌羊ASIP基因的完整转录本,并结合生物信息学方法对其结构与功能进行分析。【结果】克隆后的片段通过拼接得到一个长787 bp的序列(P1),经鉴定为酉州乌羊ASIP基因的mRNA,包括209 bp的5′UTR区,402 bp的CDS区,以及176 bp的3′UTR区,预测编码133个氨基酸,为不稳定的亲水蛋白,预测到一个约22个氨基酸的信号肽。此外,酉州乌羊ASIP基因编码区发生异义替换c.496GT,其编码的氨基酸由丙氨酸转变为缬氨酸(p.Ala96Val),该异义替换位于负责黑素皮质素受体1(MC1R)结合活性的Agouti家族保守结构域上,造成了酉州乌羊ASIP三级结构的改变。【结论】通过对酉州乌羊ASIP基因的序列特征和蛋白结构的初步分析,推测酉州乌羊皮肤组织中ASIP基因编码区发生的异义替换可能对酉州乌羊皮肤色素沉积具有影响。