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牛瘤胃未培养细菌中一个β-葡萄糖苷酶基因umbgl3A的克隆及鉴定
引用本文:赵广存,段承杰,庞浩,封毅,许跃强,莫新春,唐纪良,冯家勋.牛瘤胃未培养细菌中一个β-葡萄糖苷酶基因umbgl3A的克隆及鉴定[J].西南农业学报,2005,18(4):472-476.
作者姓名:赵广存  段承杰  庞浩  封毅  许跃强  莫新春  唐纪良  冯家勋
作者单位:1. 广西大学广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西,南宁,530005;微生物及植物遗传工程教育部重点实验室,广西,南宁,530005;广西大学生命科学与技术学院,广西,南宁,530005
2. 广西大学生命科学与技术学院,广西,南宁,530005
基金项目:国家863计划(2004AA214140);国际科技合作重点项目计划(2002AA217121)
摘    要:通过构建牛瘤胃未培养细菌的宏基因组文库,共获得12 000个克隆,文库外源DNA总容量为4.2×108 bp,筛选得到九个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆,并对其中的一个表达β-葡萄糖苷酶活性的克隆pGXN1009进行亚克隆,将β-葡萄糖苷酶基因定位在4.3 kb的片段上.测序结果表明在4.3kb的片段上有一个全长为1956 bp的ORF,编码一个可能的β-葡萄糖苷酶基因umbgl3A,其编码产物与一个来源于小鼠大肠未培养细菌的β-葡萄糖苷酶(GenBank Acession NOAAX16378.1)一致性为63%、相似性为79%;与哈氏噬纤维菌(Cytophaga hutchinsonii)的β-葡萄糖苷酶(GenBank Acession NOZP-00308419)的一致性为50%、相似性为67%.利用SMART软件对Umbgl3A结构组件预测表明,Umbgl3A包含一个家族3糖基水解酶(glycosyl hydrolase)功能域和一个家族3C糖基水解酶功能域.遗传进化分析表明umbgl3A基因可能是来自牛瘤胃微生物噬纤维菌属未培养的一个种.

关 键 词:牛瘤胃  未培养细菌  宏基因组  β-葡萄耱苷酶
文章编号:1001-4829(2005)04-0472-05
收稿时间:2005-04-26
修稿时间:2005-04-26

Cloning and identification a β-glucosidase gene umbgl3A of uncultured bacteria from bovine rumen
ZHAO Guang-cun,DUAN Cheng-jie,PANG Hao,FENG Yi,XU Yue-qiang,MO Xin-chun,TANG Ji-liang,FENG Jia-xun.Cloning and identification a β-glucosidase gene umbgl3A of uncultured bacteria from bovine rumen[J].Southwest China Journal of Agricultural Sciences,2005,18(4):472-476.
Authors:ZHAO Guang-cun  DUAN Cheng-jie  PANG Hao  FENG Yi  XU Yue-qiang  MO Xin-chun  TANG Ji-liang  FENG Jia-xun
Abstract:
Keywords:
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