| 甜荞麦脂肪酸脱氢酶基因(FeFAD)家族的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 赵训超,魏玉磊,丁冬,刘梦,盖胜男,张今杰,邵文静,李嘉欣,徐晶宇.甜荞麦脂肪酸脱氢酶基因(FeFAD)家族的鉴定与分析[J].吉林农业科学,2021,46(1):36-41. |
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| 作者姓名： | 赵训超 魏玉磊 丁冬 刘梦 盖胜男 张今杰 邵文静 李嘉欣 徐晶宇 |
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| 作者单位： | 黑龙江八一农垦大学农学院/黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室,黑龙江大庆 163319 |
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| 摘 要： | 脂肪酸是人体内不可缺少的营养成分.虽然甜荞麦(Fagopyrum esculentum Moench)籽粒中油脂含量不高,但是研究表明其含有较高的多不饱和脂肪酸,不饱和脂肪酸含量在40％左右.脂肪酸脱氢酶(FAD)是形成不饱和脂肪酸的关键酶,甜荞麦脂肪酸脱氢酶基因的研究对理解其多不饱和脂肪酸的形成及调控具有重要意义.本研究利用甜荞麦基因组数据库,以拟南芥膜结合脂肪酸脱氢酶基因(FAD)作为种子序列进行Blastp序列比对,共鉴定出10个甜荞麦FAD全长基因,并对其基因特征、进化、保守结构域、蛋白质二级和三级结构等进行分析.结果显示:10个FeFAD基因被分为6个亚族;基因特征分析显示,FeFADs基因开放阅读框长度在900～1 374 bp之间,等电点介于6.83～9.23之间;所有FeFAD基因均含有内含子,且FeFAD6的内含子数最多,含有10个内含子;除FeFAD4含有TMEM189_B_dmain结构域外,大多数Fe-
FADs均含有保守的脂肪酸脱氢酶结构域,FeSLDs除含有脂肪酸脱氢酶结构域外还含有Cyt-b5特定结构域;除FeFAD4含有HXXXH、HXXHH 2个保守组氨酸序列外,其余FeFADs均含有HXXXH、HXXHH、HXXHH 3个保守组氨酸序列;二级结构氨基酸数量预测显示FeFADs均以α-螺旋和无规则卷曲为主;三级结构预测显示大多数FeFADs三级结构各自均有自身的独特结构.本研究结果将为探究甜荞麦脂肪酸脱氢酶基因的功能提供一定的理论依据.
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| 关 键 词： | 甜荞麦 脂肪酸脱氢酶基因 基因家族 生物信息学 |
Genome-wide Identification and Bioinformatics Analysis of Fatty Acid Desaturase Gene(FeFAD) Family in Common Buckwheat |
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| ZHAO Xunchao,WEI Yulei,DING Dong,LIU Meng,GE Shengnan,ZHANG Jinjie,SHAO Wenjing,LI Jiaxin,XU Jingyu.Genome-wide Identification and Bioinformatics Analysis of Fatty Acid Desaturase Gene(FeFAD) Family in Common Buckwheat[J].Jilin Agricultural Sciences,2021,46(1):36-41. |
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| Authors: | ZHAO Xunchao WEI Yulei DING Dong LIU Meng GE Shengnan ZHANG Jinjie SHAO Wenjing LI Jiaxin XU Jingyu |
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