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凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因
引用本文:盛小伟,高永华,彭金霞,李咏梅,陈晓汉,熊建华.凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因[J].南方农业学报,2012,42(2):192-196.
作者姓名:盛小伟  高永华  彭金霞  李咏梅  陈晓汉  熊建华
作者单位:(1 广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心 南宁 530021 2 桂林理工大学化学与生物工程学院 广西桂林 541000)
基金项目:国家科技支撑计划项目(2008BADB9B03);国家虾产业技术体系岗位科学家经费项目(nycytx-46);广西直属公益性科研院所基本科研业务项目(2060302GXIF-2008-02)
摘    要:【目的】了解类泛素折叠修饰蛋白(Ufm1)的结构特征和蛋白功能,为进一步探究Ufm1基因功能提供参考。【方法】以同一生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织为材料,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,通过斑点杂交筛选获得Ufm1基因,经全长cDNA文库筛选获得Ufm1基因全长序列。【结果】Ufm1基因全长cDNA序列长714 bp,包含261 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为86个氨基酸,预测的分子量为9.3 ku,等电点pI为6.55;其编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,可能定位于细胞质中,属于亲水性蛋白,含有1个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点;序列同源性分析表明,不同进化地位物种的Ufm1基因存在较高的同源性。【结论】Ufm1基因在系统进化上高度保守,这为进一步探究Ufm1基因功能及原核表达等奠定了基础。

关 键 词:凡纳滨对虾  差减cDNA文库  Ufm1基因  生物信息学
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