凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因 |
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引用本文: | 盛小伟,高永华,彭金霞,李咏梅,陈晓汉,熊建华.凡纳滨对虾类泛素折叠修饰蛋白Ufm1基因[J].南方农业学报,2012,42(2):192-196. |
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作者姓名: | 盛小伟 高永华 彭金霞 李咏梅 陈晓汉 熊建华 |
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作者单位: | (1 广西水产研究所南美白对虾遗传育种中心 南宁 530021 2 桂林理工大学化学与生物工程学院 广西桂林 541000) |
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基金项目: | 国家科技支撑计划项目(2008BADB9B03);国家虾产业技术体系岗位科学家经费项目(nycytx-46);广西直属公益性科研院所基本科研业务项目(2060302GXIF-2008-02) |
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摘 要: | 【目的】了解类泛素折叠修饰蛋白(Ufm1)的结构特征和蛋白功能,为进一步探究Ufm1基因功能提供参考。【方法】以同一生长性状分离凡纳滨对虾家系的肌肉组织为材料,构建凡纳滨对虾生长性状差减cDNA文库,通过斑点杂交筛选获得Ufm1基因,经全长cDNA文库筛选获得Ufm1基因全长序列。【结果】Ufm1基因全长cDNA序列长714 bp,包含261 bp的开放阅读框,推测编码的蛋白质为86个氨基酸,预测的分子量为9.3 ku,等电点pI为6.55;其编码蛋白无信号肽,无跨膜区域,可能定位于细胞质中,属于亲水性蛋白,含有1个酪蛋白激酶II磷酸化位点、1个N-糖基化位点、2个蛋白激酶C磷酸化位点;序列同源性分析表明,不同进化地位物种的Ufm1基因存在较高的同源性。【结论】Ufm1基因在系统进化上高度保守,这为进一步探究Ufm1基因功能及原核表达等奠定了基础。
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关 键 词: | 凡纳滨对虾 差减cDNA文库 Ufm1基因 生物信息学 |
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