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辣椒推定WRKY基因cDNA的生物信息学分析
作者姓名:王育娜  贺俐  曹蕾  赖燕  牟少亮  何水林
作者单位:福建农林大学生命科学学院,洛阳师范学院生命科学系,井岗山大学生命科学学院,漳州农业学校
摘    要:研究目的]该研究在利用同源克隆法分离到一个推定的辣椒WRKY转录因子的基础上,采用多种生物信息学方法对该序列进行特征分析和功能预测,以获得该基因及其编码蛋白更多的功能提示.主要方法]应用Blast、ORF Finder、Wolf Psort、DNAMAN等软件或数据库,进行序列的相似性比较,开放读码框预测、保守域和编码蛋白质的功能等分析.研究结果]所得到的序列是WRKY基因家族中的一个全长cDNA序列,与其它植物具有较高的同源性,该基因编码的蛋白具有WRKY保守结构域和锌指结构特征,亚细胞定位预测结果显示该蛋白定位于细胞核,具有WRKY转录因子的三维结构特征.结论]所获得序列为辣椒WRKY基因家族的新成员,具有WRKY转录因子家族的基本特征,进化上有高度保守性.可能在调控植物的生长发育以及干旱、高温、高盐等逆境应答过程中起重要调节作用.因此.这一辣椒WRKY新基因有进一步研究的价值.

关 键 词:辣椒  转录因子  生物信息学

Bioinformation Analyze of a Pepper Putative WRKY gene
Authors:Wang Yun  He Li  Cao Lei  Lai Yan  Mou Shaoliang  He Shuilin
Abstract:
Keywords:WRKY
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