| 总状毛霉丝氨酸蛋白酶基因结构和功能的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 柯野,曾松荣,郑秋桦.总状毛霉丝氨酸蛋白酶基因结构和功能的生物信息学分析[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2012(4):370-376. |
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| 作者姓名： | 柯野 曾松荣 郑秋桦 |
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| 作者单位： | 韶关学院 英东生命科学学院 ,广东 韶关 512005 |
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| 基金项目： | 广东省科技计划资助项目(2011B010500018) |
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| 摘 要： | 利用PCR和RACE(cDNA末端快速扩增)技术从总状毛霉中克隆获得1个丝氨酸蛋白酶新基因,利用生物信息学方法对该基因序列、编码的酶序列以及酶性质和结构进行预测。结果表明:该基因编码区序列长1 421bp,由3个外显子和2个内含子组成,编码由429个氨基酸残基组成的多肽;对该多肽的组成和进化分析表明,其成熟肽属于蛋白酶K家族的胞外蛋白酶;通过同源建模结构分析表明,该酶没有二硫键,有152个氢键和29个盐键,酶的Glu190、Ala192和Asp215残基与一个Ca2+相结合,酶活性位点残基Asp44和Ser241溶剂可及表面积较大,分别达到0.211 42和3.309 32;该酶的底物结合区域中,S1和S4口袋结构明显,S2次之,S3最不明显,部分组成S1和S4口袋的氨基酸残基不保守,这可能使该酶具有独特的水解性。上述结果可为该蛋白酶基因的异源表达和结构与功能关系等方面的研究提供参考。
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| 关 键 词： | 总状毛霉 丝氨酸蛋白酶基因 生物信息学分析 |
Bioinformatics analysis of structure and function of serine protease gene from Mucor racemosus |
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| KE Ye,ZENG Song-rong,ZHENG Qiu-hua.Bioinformatics analysis of structure and function of serine protease gene from Mucor racemosus[J].Journal of Zhejiang University(Agriculture & Life Sciences),2012(4):370-376. |
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| Authors: | KE Ye ZENG Song-rong ZHENG Qiu-hua |
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| Institution: | (Yingdong College of Life Sciences,Shaoguan University,Shaoguan,Guangdong 512005,China) |
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