香蕉穿孔线虫组织蛋白酶B基因的克隆与分析 |
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引用本文: | 李丹蕾,李宇,谢辉,徐春玲,黄欣.香蕉穿孔线虫组织蛋白酶B基因的克隆与分析[J].浙江大学学报(农业与生命科学版),2013(1):26-33. |
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作者姓名: | 李丹蕾 李宇 谢辉 徐春玲 黄欣 |
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作者单位: | 华南农业大学资源环境学院植物检疫线虫检测与防疫研究中心/植物线虫研究室;东北林业大学林学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目(31071665);国家公益性行业(农业)科研专项资助项目(200903040) |
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摘 要: | 为了获得香蕉穿孔线虫的组织蛋白酶B基因,分析该基因的序列、结构及其功能,为进一步研究植物寄生线虫组织蛋白酶的功能及其在线虫防治中的应用提供科学依据。我们应用SMART技术构建了香蕉穿孔线虫cDNA文库;采用SL法,克隆得到香蕉穿孔线虫组织蛋白酶B基因全长cDNA,通过测序获得1 257bp全长序列,命名为Rs-cb-1(GenBank:GU360972),该基因cDNA全长序列包括1 071bp的完整ORF,编码356个氨基酸,蛋白质相对分子质量为41 400。对该基因的序列结构及其编码的蛋白2级结构和三维结构与功能进行分析和预测结果表明,Rs-cb-1序列与其他寄生虫的组织蛋白酶B基因序列相比,该基因与秀丽小杆线虫组织蛋白酶B基因的亲缘关系最近;其编码蛋白主要为细胞外分泌蛋白,定位于微体(过氧化物酶体)、内质网膜和内质网管腔上,约有25个氨基酸跨膜区段位于蛋白质的C端,其表面电荷呈明显的极性分布;另外,通过同源建模获得该蛋白的三维结构预测图,这些结构与已报道的组织蛋白酶B生物学功能相符。本研究分离克隆得到的Rs-cb-1,是首个分离克隆得到的香蕉穿孔线虫组织蛋白酶B基因,从而为该线虫组织蛋白酶的进一步研究奠定了基础。
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关 键 词: | 香蕉穿孔线虫 组织蛋白酶B基因 基因克隆 cDNA文库 序列分析 |
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