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西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析
引用本文:何丹,海利力·库尔班,玉山江·麦麦提,李继阳,杨渡,韩盛.西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析[J].新疆农业科学,2015,52(10):1849.
作者姓名:何丹  海利力·库尔班  玉山江·麦麦提  李继阳  杨渡  韩盛
作者单位:新疆农业大学林学与园艺学院,乌鲁木齐,830091;新疆农业科学院植物保护研究所,乌鲁木齐,830091
摘    要:目的]研究新疆甜瓜主栽区西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白的分类地位,以及与国内外分离株亲缘关系.方法]田间采集具有西瓜花叶病毒症状的幼嫩叶片,利用改良的TRIZOL总RNA提取法获取RNA,进一步分离纯化、克隆及测序,将测序结果利用BLAST、DNAMAN 5.0、CLUSTAL X、MEGA 5.0 EXPASY、TM-HMM等软件进行碱基和氨基酸序列比对,以及疏水性平均值、脂肪系数、亲缘关系等分析.结果]序列比对发现8个地区WMV病毒外壳蛋白核酸序列的5'端保守性较高,碱基和氨基酸序列相似性分别达到86.25;和93.01;,存在部分碱基和氨基酸突变,相似性较高.结论]通过分子进化树可得出新疆8个分离物之间亲缘性关系较近,同源性较高,与国内外其它地区的亲缘性关系较远、同源性较低.

关 键 词:甜瓜  西瓜花叶病毒  外壳蛋白  序列分析
收稿时间:2015-06-25

Coat Protein Gene Cloning and Sequence Analysis of Watermelon Mosaic Virus (WMV) in Xinjiang Main Planting Areas
HE Dan,Halili Kuerban,Yushanjiang Meimeiti,LI Ji-yang,YANG Du,HAN Sheng.Coat Protein Gene Cloning and Sequence Analysis of Watermelon Mosaic Virus (WMV) in Xinjiang Main Planting Areas[J].Xinjiang Agricultural Sciences,2015,52(10):1849.
Authors:HE Dan  Halili Kuerban  Yushanjiang Meimeiti  LI Ji-yang  YANG Du  HAN Sheng
Abstract:
Keywords:
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