| 基于高通量测序的技术检测梨树病毒 |
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| 引用本文： | 杨洁萍,周丽,马丽,全绍文,覃阳,牛建新.基于高通量测序的技术检测梨树病毒[J].新疆农业科学,2020,57(8):1503-1513. |
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| 作者姓名： | 杨洁萍 周丽 马丽 全绍文 覃阳 牛建新 |
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| 作者单位： | 石河子大学农学院园艺系/特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室,新疆石河子 832003 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(30360066、31360474);高等学校博士学科点专项科研基金博导类联合课题(2013651810002) |
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| 摘 要： | 【目的】 研究运用基于高通量测序的技术检测梨树病毒,为梨树病毒的检测提供新方法。【方法】 于2014年、2017年、2018年4月中旬采集库尔勒香梨花朵若干,分别进行转录组测序,将得到的序列经过转录本拼接、层次聚类和基因功能注释,筛选出注释为植物病毒的序列作为候选病毒序列。利用RT-PCR方法检测随机采集的香梨枝条样品,验证高通量测序结果的可靠性。【结果】 根据3组转录组测序数据的生物信息学分析结果,分别对注释为来源于植物病毒的66、202和921条基因序列进行分析。3种梨树中已报道的病毒,分别是苹果茎痘病毒、苹果茎沟病毒和苹果褪绿叶斑病毒,以及梨树中未报道的芸薹黄化病毒。采用设计的特异性引物,通过RT-PCR技术对筛选出的4种病毒进行扩增验证,结果扩增出苹果茎痘病毒和苹果茎沟病毒的目的片段。【结论】 高通量测序技术可作为检测梨树病毒的一种快速、有效手段。
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| 关 键 词： | 梨 高通量测序 RT-PCR 病毒 |
| 收稿时间： | 2019-11-19 |
Detection of Pear Virus by High-Throughput Sequencing Technology |
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| YANG Jieping,ZHOU Li,Ma Li,QUAN Shaowen,Qin Yang,NIU Jianxin.Detection of Pear Virus by High-Throughput Sequencing Technology[J].Xinjiang Agricultural Sciences,2020,57(8):1503-1513. |
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| Authors: | YANG Jieping ZHOU Li Ma Li QUAN Shaowen Qin Yang NIU Jianxin |
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| Institution: | Key Laboratory of Special Fruits and Vegetables Cultivation Physiology and Germplasm Resources Utilization of XPCC / Department of Horticulture,College of Agriculture,Shihezi University,Shihezi Xinjiang 832003,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pear high-throughput sequencing RT-PCR virus |
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