芒属植物叶绿体InDel标记的开发与应用 |
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引用本文: | 薛宏,易自力,肖亮,丁力,彭思佳,蒋建雄.芒属植物叶绿体InDel标记的开发与应用[J].现代农业科技,2015(7). |
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作者姓名: | 薛宏 易自力 肖亮 丁力 彭思佳 蒋建雄 |
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作者单位: | 1. 湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙 410128;湖南省蚕桑科学研究所 2. 湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙,410128 |
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基金项目: | 863计划,国家支撑计划 |
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摘 要: | 研究利用芒属植物(芒02381和荻04005)叶绿体全基因组测序的结果,开发12对InDel标记。采用正交设计法优化cpInDelPCR体系,得到模板DNA、dNTPs、Mg2+、引物、TaqDNA聚合酶5个关键因素在体系中的最佳组合。12对InDel标记对43份芒属和2份甘蔗材料进行扩增,共扩增出538条条带,其中3对引物扩增出13条多态性条带,占总数的2.4%。将所有位点读带转化为数值矩阵并用UPGMA法聚类,在遗传相似系数1.4的水平上,和南荻聚为一类,而芒和与五节芒、双药芒、红山茅、尼泊尔芒、甘蔗聚为一类,4个具有杂交种特征的材料单独聚为一类。试验开发的芒属植物cpInDel标记可用于芒与荻的区分,指导芒属植物的杂交育种。
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关 键 词: | 芒属植物 叶绿体 InDel标记 育种 应用 |
Development and Application of Chloroplast Insertion/Delection Markers for Miscanthus Andersson |
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Authors: | XUE Hong YI Zi-li XIAO Liang DING Li PENG Si-jia JIANG Jian-xiong |
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Abstract: | |
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Keywords: | Miscanthus Anderss chloroplast InDel marker breeding application |
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