| 大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 高姗姗,冯浩,黄鑫,张鑫月,张泽阳,刘贵河.大麦CIPK基因家族鉴定及表达分析[J].现代农业科技,2024(4). |
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| 作者姓名： | 高姗姗 冯浩 黄鑫 张鑫月 张泽阳 刘贵河 |
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| 作者单位： | 河北北方学院,北京市农林科学院,河北工程大学,河北师范大学,河北北方学院,河北北方学院 |
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| 基金项目： | 国家财政部和农业农村部:现代农业产业技术体系(CARS-34);河北省林业和草原科学研究项目(2113055) |
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| 摘 要： | 钙调神经磷酸酶B样相互作用蛋白激酶(CIPK)蛋白家族是由Ca2+介导的植物信号通路中的关键蛋白家族,在植物抗逆和生长发育中起关键作用。本研究将生物信息学方法和转录组数据分析相结合,挖掘出大麦31个HvCIPK基因家族成员并将其分为5个亚家族。HvCIPKs基因家族成员具有CIPKs典型的N端激酶结构域和C端NAF调节结构域；蛋白质分子量在40302.27~89926.43KDa之间,为亲水性蛋白；启动子总共包含11种与非生物胁迫、激素调控以及生长发育相关的顺式作用元件；蛋白互作网络预测结果显示,HvCIPKs与Na+、K+转运体、ABA信号通路关键蛋白(SOS1、AKT1和ABL2)存在相互作用关系；转录组数据分析发现HvCIPK1、HvCIPK2、HvCIPK6、HvCIPK9、HvCIPK11受盐碱胁迫的诱导表达。该研究为进一步探索大麦HvCIPKs基因家族功能及调控机制提供理论依据。
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| 关 键 词： | CIPK 大麦 基因家族 生物信息学 蛋白激酶 |
| 收稿时间： | 2023/5/3 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/5/3 0:00:00 |
Identification and Expression Analysis of Hordeum vulgare CIPK gene family |
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| Authors: | Guihe Liu |
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| Institution: | Hebei North University,Zhangjiakou |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | CIPK Barley Gene family Bioinformatics protein kinase[1] |
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