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多烯大环类抗生素合成酶结构域的差异进化分析及应用于一株产四霉素链霉菌菌株的筛选
引用本文:王绛,唐克轩,邓子新,黄曦.多烯大环类抗生素合成酶结构域的差异进化分析及应用于一株产四霉素链霉菌菌株的筛选[J].上海交通大学学报(农业科学版),2011,29(1):1-9.
作者姓名:王绛  唐克轩  邓子新  黄曦
作者单位:1. 上海交通大学生命科学技术学院,教育部微生物代谢重点实验室,上海,200030;上海交通大学农业与生物学院,上海,200240;中国科学院上海有机化学研究所,生命有机国家重点实验室,上海,200032
2. 上海交通大学农业与生物学院,上海,200240
3. 上海交通大学生命科学技术学院,教育部微生物代谢重点实验室,上海,200030
摘    要:多烯大环类抗生素的生物合成酶属于典型的Ⅰ类聚酮合酶(PKS),这些生物大分子有着非常相似的化学结构和模块合成的形式.在本研究中,每个多烯聚酮合酶的单一结构域被作为系统进化分析的对象.我们发现,各类结构域在进化上出现了不同方向的倾向,其中,KS域在进化树中归成三大类,分别对应多烯结构的三大块区域;相对于KS域和ACP域表...

关 键 词:多烯大环  结构域  差异进化  聚酮合酶  四霉素

Different Evolution on Domains of Polyene Macrolide Antibiotics Biosynthases Implying New Insights to Combinational Biosynthesis and Mining a New Tetramycin Producing Streptomyces Strain
Jiang Wang,Kexuan Tang,Zixin Deng,Xi Huang.Different Evolution on Domains of Polyene Macrolide Antibiotics Biosynthases Implying New Insights to Combinational Biosynthesis and Mining a New Tetramycin Producing Streptomyces Strain[J].Journal of Shanghai Jiaotong University (Agricultural Science),2011,29(1):1-9.
Authors:Jiang Wang  Kexuan Tang  Zixin Deng  Xi Huang
Institution:Jiang Wang1,2,3,Kexuan Tang2,Zixin Deng1,Xi Huang1(1.Laboratory of Microbial Metabolism and School of Life Sciences and Biotechnology,Shanghai Jiao Tong University,Shanghai 200030,China,2.Plant Biotechnology Research Center,School of Agriculture and Biology,Shanghai 200240,3.State Key Laboratory of Bioorganic and Natural Products Chemistry,Shanghai Institute of Organic Chemistry,Chinese Academy of Sciences,345 Lingling Rd,Shanghai 200032,China)
Abstract:Biosynthases of polyene macrolides antibiotic belong to typical type I modular polyketide synthases(PKS).Their common structural traits and similar module-biosynthesis suggested the closely evolutional relationship among their biosynthases.In our study,individual domains in each polyene PKS were selected to be taken phylogenetic analysis.We found that different kinds of domains exhibited different evolutional direction:three groups of KS domains responsible for three structural parts of polyenes;duplication...
Keywords:polyene antibiotic  domain  different evolution  PKS  tetramycin  
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