毛竹Phyllostachys edulis retrotransposon 7（PHRE7）转座子的克隆与鉴定

长末端重复序列（LTR）反转录转座子广泛存在于植物基因组中，本质是一段可移动的脱氧核糖核酸（DNA）序列。大多数LTR反转录转座子在外界环境变化下能够被激活转录，对环境变化做出响应。为研究毛竹基因组中的LTR反转录转座子的转录活性及在非生物环境胁迫下表达量的具体变化，克隆和鉴定了1个毛竹Phyllostachys edulis反转录转座子PHRE7。该转座子全长为6 073 bp，属于Ty1-copia家族中的Tork分支，LTR序列相似性为96.7%，插入时间为126.923万a前。对毛竹实生苗分别进行辐照（30，50，70 Gy），甲基化抑制剂（50，100，150 μmol·L-1），高温（42℃），低温（4℃），高盐（0.1，0.2，0.3 mol·L-1）等5种不同胁迫处理，通过定量荧光聚合酶链式反应（PCR）检测，PHRE7在INT，RT和RH等3个结构域中的表达量仅在辐照及0.2~0.3 mol·L-1高盐处理下随处理强度的上升而下降，其余所有处理（甲基化抑制剂、高温、低温、高盐0.1~0.2 mol·L-1）的表达量都随处理强度呈上升趋势。这些结果表明:PHRE7转座子是一个具有转录活性的LTR反转录转座子，且外界非生物环境胁迫对其表达模式有较大影响，表明PHRE7转座子能够响应外界环境变化。

Cloning and characterization of a long terminal repeat retrotransposon (Phyllostachys edulis retrotransposon 7) in Phyllostachys edulis