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麻疯树遗传多样性的相关序列扩增多态性(SRAP)分析
引用本文:沈俊岭,倪慧群,陈晓阳,黄少伟.麻疯树遗传多样性的相关序列扩增多态性(SRAP)分析[J].浙江林学院学报,2010,27(3):347-353.
作者姓名:沈俊岭  倪慧群  陈晓阳  黄少伟
作者单位:1. 北京林业大学,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083
2. 华南农业大学,林学院,广东,广州,510642
3. 北京林业大学,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,北京,100083;华南农业大学,林学院,广东,广州,510642
基金项目:"十一五"国家科技支撑计划项目,广东省科技攻关重点项目 
摘    要:采用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记对中国6省(区)及印度尼西亚共8个麻疯树Jatropha curcas种源样本进行研究,旨在阐明麻疯树种源间的遗传关系和遗传多样性。结果表明:麻疯树相关序列扩增多态性?鄄聚合酶链式反应(SRAP-PCR)最佳反应体系为:10 × PCR buffer 2 μL,DNA模板20 ng,Taq酶16.67 nkat,Mg2+ 2.50 mmol·L-1,三磷酸脱氧核苷酸(dNTP)120.00 μmol·L-1,引物0.15 μmol·L-1,总体积为20 μL;并从274对引物中选出具有多态性的45对引物,共检测出500条清晰的条带,其中多态性条带141条,占总条带数的28.20 %。非加权成对算术平均法(UPGMA)聚类分析及主成分分析表明,各个种源间的亲缘关系均很近,其相似系数为0.791 ~ 0.940,8个种源被聚为3类,其中印度尼西亚种源单独聚为1类,来自不同地域的7个中国种源被混聚为另外2类。图6表3参16

关 键 词:林木育种学  麻疯树  相关序列扩增多态性-聚合酶链式反应  亲缘关系  聚类分析  主成分分析

Genetic diversity of Jatropha curcas with SRAP molecular markers
SHEN Jun-ling,NI Hui-qun,CHEN Xiao-yang,HUANG Shao-wei.Genetic diversity of Jatropha curcas with SRAP molecular markers[J].Journal of Zhejiang Forestry College,2010,27(3):347-353.
Authors:SHEN Jun-ling  NI Hui-qun  CHEN Xiao-yang  HUANG Shao-wei
Institution:SHEN Jun-ling1,NI Hui-qun2,CHEN Xiao-yang1,2,HUANG Shao-wei2 (1. The Key Laboratory for Genetics , Breeding in Forest Trees , Ornamental Plants of Ministry of Education,Beijing Forestry University,Beijing 100083,China,2. Forestry College,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,Guangdong,China)
Abstract:To investigate genetic relationships and genetic diversity of Jatropha curcas,seven populations from six provinces of China and one from Indonesia were analyzed using polymerase chain reaction (PCR) with sequence related amplified polymorphic (SRAP) DNA molecular markers. The L16(45) orthogonal experimental design was utilized to optimize the SRAP amplification system with Jaccard's similarity coefficient as well as cluster and principle component analyses being employed. The optimum reaction concentrations...
Keywords:forest tree breeding  Jatropha curcas  SRAP-PCR  genetic relation  cluster analysis  prin-ciple component analysis  
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