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| 水稻土氨氧化细菌多样性的RFLP分析 | |
| 引用本文： | 李惠民,程 林,王保莉,曲 东.水稻土氨氧化细菌多样性的RFLP分析[J].西北农业学报,2011,20(5):111-116. |
| 作者姓名： | 李惠民 程 林 王保莉 曲 东 |
| 作者单位： | 1. 西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌,712100;商洛职业技术学院,陕西商洛,726000 2. 西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌,712100 3. 西北农林科技大学资源环境学院,陕西杨凌,712100 |
| 摘 要： | 提取苗期水稻根际土和非根际土土样微生物总DNA,采用氨氧化细菌特异性引物(Eub338,Nso1225)扩增16SrDNA基因片段,分别建立水稻根际土(G)和非根际土(F)氨氧化细菌克隆文库。用限制性内切酶HhaⅠ/RsaⅠ进行PCR-RFLP分型,分别得到110和105个酶切类型。多样性指数和优势细菌聚类比对结果显示,土壤氨氧化细菌群落结构指数H′、Dg和Jgi为非根际土稍大于根际土,表明非根际土中氨氧化细菌种群比根际土略多。指数Hmax和dMax为根际土大于非根际土,表明根际土氨氧化细菌数量相对多于非根际土。根际土有比非根际土更明显的优势种群出现。序列分析表明,水稻根际土氨氧化细菌的优势种群主要属于亚硝化螺菌属,亚硝化单胞菌属,β-变形菌亚门,碱菌属。供试水稻根际土和非根际土氨氧化细菌多样性和群落结构发生了改变。 |
| 关 键 词： | 水稻土 氨氧化细菌 多样性 RFLP |
RFLP Analysis of Ammonia Oxidizing Bacteria Diversity in Paddy Soil |
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| LI Huimin,CHENG Lin,WANG Baoli and QU Dong.RFLP Analysis of Ammonia Oxidizing Bacteria Diversity in Paddy Soil[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2011,20(5):111-116. | |
| Authors: | LI Huimin CHENG Lin WANG Baoli and QU Dong |
| Institution: | LI Huimin1,2,CHENG Lin1,WANG Baoli1 and QU Dong3(1.College of Life Science,Northwest A&F University,Yangling Shaanxi 712100,China,2.Shangluo Professional Technical College,Shangluo Shaanxi 726000,3.College of Resources and Environment,China) |
| Abstract: | Ammonia-oxidizing microbes play an important role in the biogeochemical cycle of N element and limit the rate of nitrification.The diversity and composition of the rhizosphere paddy soil and bulk paddy soil ammonia-oxidizing bacteria were analyzed through constructing its 16S rDNA gene clone library and by PCR-based Restriction Fragment Length Polymorphism analysis(RFLP).Total genome DNA of soil microorganism was extracted from the rhizosphere paddy soil(G) and bulk paddy soil(F).16S rDNAs of the extracted ... |
| Keywords: | Paddy soil Ammonia oxidizing bacteria Diversity Restriction fragment length polymorphism(RFLP) |
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