| 小麦BES1转录因子全基因组鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 卢 晨,李 寒,王书平,张迎新,尹军良,马东方,方正武.小麦BES1转录因子全基因组鉴定与分析[J].西北农业学报,2021,30(3):365-376. |
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| 作者姓名： | 卢 晨 李 寒 王书平 张迎新 尹军良 马东方 方正武 |
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| 作者单位： | （1.长江大学 农学院，主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心，湖北荆州 434025；2.西北农林科技大学，旱区作物逆境生物学国家重点实验室，陕西杨陵 712100） |
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| 基金项目： | 湖北省技术创新专项（2018ABA085）；大学生创新创业计划（2019268）。 |
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| 摘 要： | 为了解小麦中 BES1基因家族功能,根据已公布的小麦基因组信息(IWGSC v1.1),对小麦 BES1基因家族进行全基因组鉴定。根据已报道的 BES1基因,采用同源比对法检索小麦基因组中的 BES1家族基因,pfam鉴定并进行编号,通过ExPASy Proteomics Server预测小麦 BES1氨基酸序列的基本信息,利用Cell-PLoc进行亚细胞定位预测,采用MEGA 7软件构建进化树,利用R软件包pheatmap绘制启动子的热图和circlize绘制同源关系图谱。结果表明,小麦共有15个 BES1基因,被分为4组;小麦 BES1编码的蛋白质等电点为8.13～9.4,不稳定指数为50.78～69.99;小麦 BES1启动子区域一共含有838个顺式元件,471(56.2%)个与生长发育有关,201(24%)个与非生物/生物胁迫有关,166(19.8%)个与激素反应有关;与普通小麦相关的同源物共52对,有13对(25%)旁系同源物和39对(75%)直系同源物。表明小麦 BES1基因家族包括15个成员,全部为碱性蛋白质和不稳定蛋白质,小部分(13对25%)来源于自身的进化,大部分(39对75%)来源于3种亚基因组供体小麦。
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| 关 键 词： | 小麦BES1基因 全基因组鉴定 启动子分析 同源性进化分析 |
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