| 小麦KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析 |
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| 引用本文： | 吴胜男,杨 媛,李英壮,王 娜,谢彦周,简俊涛,杨 辉,王成社.小麦KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定、系统进化和表达模式分析[J].西北农业学报,2021,30(3):351-364. |
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| 作者姓名： | 吴胜男 杨 媛 李英壮 王 娜 谢彦周 简俊涛 杨 辉 王成社 |
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| 作者单位： | （1.西北农林科技大学 农学院，旱区作物逆境生物学国家重点实验室，陕西杨凌 712100；2.南阳市农业科学院，河南南阳 473000） |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划（2016YFD0102101）；国家自然科学基金（31101139）。 |
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| 摘 要： | 为深入发掘小麦KUP/HAK/KT基因的功能,利用小麦最新基因组数据,通过生物信息学手段,对小麦KUP/HAK/KT基因家族进行基因组水平的鉴定,并对其系统进化及表达模式进行分析。鉴定结果表明,本研究在小麦中鉴定到98个KUP/HAK/KT基因,根据系统进化分析结果,可将其分为ClusterⅠ、ClusterⅡ、ClusterⅢ和ClusterⅣ4个进化簇,不同进化簇具有特异的基因结构。染色体定位结果表明,小麦21条染色体上均含有KUP/HAK/KT基因,每条染色体上有2～9个KUP/HAK/KT基因。通过对小麦KUP/HAK/KT基因复制事件的分析发现小麦KUP/HAK/KT基因共产生92个基因复制。此外,转录组数据分析发现小麦KUP/HAK/KT基因在逆境胁迫下存在差异表达,多个胁迫响应相关的KUP/HAK/KT基因被鉴定到,为小麦KUP/HAK/KT基因功能的研究提供了初步的理论依据。
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| 关 键 词： | 小麦 KUP/HAK/KT 系统进化 表达模式 |
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