| 天祝白牦牛IGF-1基因克隆、生物信息学及差异表达分析 |
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| 引用本文： | 常永芳,包鹏甲,张永峰,付东海,吴晓云,褚 敏,阎 萍.天祝白牦牛IGF-1基因克隆、生物信息学及差异表达分析[J].西北农业学报,2019,28(12):1934-1941. |
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| 作者姓名： | 常永芳 包鹏甲 张永峰 付东海 吴晓云 褚 敏 阎 萍 |
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| 作者单位： | （1.西北民族大学 生命科学与工程学院，兰州 730030；2.中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所，甘肃省牦牛繁育工程重点实验室，兰州 730050） |
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| 基金项目： | 国家现代农业(肉牛牦牛)产业技术体系建设专项(CARS-37)；中国农业科学院创新工程(CAASASTRP-2014-LIHPS-01)。 |
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| 摘 要： | 旨在获得天祝白牦牛 IGF-1基因序列,分析其分子结构特征及在牦牛毛囊发育周期中的表达规律,为解析白牦牛毛囊发育及被毛生长提供理论依据。以天祝白牦牛体侧皮肤为试验材料,通过PCR扩增及测序技术克隆 IGF-1基因CDS区序列,并与黄牛序列比对,进行生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测天祝白牦牛毛囊发育不同时期 IGF-1基因的mRNA表达水平。结果表明,天祝白牦牛 IGF-1基因的CDS区长465 bp,编码154个氨基酸; IGF-1基因编码蛋白的分子质量为17 065. 81 ku,理论等电点为9.36;蛋白质二级结构以无规卷曲(57.79%)和α-螺旋(27.27%)为主,序列分析表明,天祝白牦牛IGF-1蛋白为不稳定亲水蛋白;qPCR检测结果表明, IGF-1基因在牦牛毛囊发育的生长期、退行期和休止期均有表达,生长期和退行期表达量显著高于休止期。
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| 关 键 词： | IGF-1基因 天祝白牦牛 克隆 生物信息学 |
Cloning, Bioinformation Analyzing, and Expressional Detecting for IGF-1 in Tianzhu White Yak |
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| CHANG Yongfang,BAO Pengji,ZHANG Yongfeng,FU Donghai,WU Xiaoyun,CHU Min and YAN Ping.Cloning, Bioinformation Analyzing, and Expressional Detecting for IGF-1 in Tianzhu White Yak[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2019,28(12):1934-1941. |
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| Authors: | CHANG Yongfang BAO Pengji ZHANG Yongfeng FU Donghai WU Xiaoyun CHU Min and YAN Ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | IGF-1 genes Tianzhu white yak Clone Bioinformatics |
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