| 样本数量和终质量浓度对DNA混合池PCR扩增质量和测序效果的影响 |
| |
| 引用本文： | 徐建峰,容维中,石福岳,王燕燕,董 和,高 博,张艳丽,李振明. 样本数量和终质量浓度对DNA混合池PCR扩增质量和测序效果的影响[J]. 西北农业学报, 2019, 28(5): 681-685 |
| |
| 作者姓名： | 徐建峰 容维中 石福岳 王燕燕 董 和 高 博 张艳丽 李振明 |
| |
| 作者单位： | (1.甘肃省畜牧兽医研究所，甘肃平凉 744000；2.平凉市农产品质量安全检测检验中心，甘肃平凉 744000；3.宁县畜牧兽医局，甘肃宁县 745200) |
| |
| 基金项目： | 甘肃省重点研发计划-农业类（17YF1NL052）。 |
| |
| 摘 要： | 为筛选适宜的DNA混合池法,采用两因素交叉分组设计,以混合样本数量(20、60和150个)和终质量浓度(50、100和150 ng/μL)为组合因子,分析不同混合池对PCR扩增质量及SNPs检出率的影响。结果表明:在同一混合样本数量下,以终质量浓度100 ng/μL建立的DNA混合池扩增的PCR产物纯度和OD_(260)/OD_(280)均优于50 ng/μL,但对测序结果无显著影响;以终质量浓度150 ng/μL建立的DNA混合池扩增的PCR产物杂带较多,不符合测序要求。在同一混合样本终质量浓度下,混合样本数越多,SNPs检出率越高。综上,从PCR扩增质量、SNPs检出率和试验成本来分析,以混合样本150个、终质量浓度100 ng/μL组合建立的DNA混合池效果最好。
|
| 关 键 词： | DNA混合池；样本数量；终质量浓度；早胜牛；PCR扩增；SNPs |
Effects of Sample Numbers and Final Mass Concentration on PCR Amplification Quality and Sequencing Result with DNA Mixing Pool |
| |
| XU Jianfeng,RONG Weizhong,SHI Fuyue,WANG Yanyan,DONG He,GAO Bo,ZHANG Yanli and LI Zhenming. Effects of Sample Numbers and Final Mass Concentration on PCR Amplification Quality and Sequencing Result with DNA Mixing Pool[J]. Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica, 2019, 28(5): 681-685 |
| |
| Authors: | XU Jianfeng RONG Weizhong SHI Fuyue WANG Yanyan DONG He GAO Bo ZHANG Yanli LI Zhenming |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | DNA mixing pool Sample numbers Final mass concentration Zaosheng cattle PCR amplification SNPs |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《西北农业学报》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《西北农业学报》下载全文 |
|
