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马链球菌马亚种新疆株SeM基因的克隆及序列差异分析
引用本文:刘云涛,王彩蝶,夏利宁,苏 艳.马链球菌马亚种新疆株SeM基因的克隆及序列差异分析[J].西北农业学报,2015,24(3):14-19.
作者姓名:刘云涛  王彩蝶  夏利宁  苏 艳
作者单位:新疆农业大学动物医学学院
基金项目:国家科技支撑项目(2012BAB46B01);新疆维吾尔自治区普通高校重点学科基础兽医学科项目
摘    要:为研究马链球菌马亚种新疆株SeM基因的分子特征,分析新疆地区马链球菌马亚种的分子流行特征以及为马腺疫的防治提供依据,对分离并鉴定的5株马链球菌马亚种提取基因组、扩增并克隆其SeM基因(GenBank登录号分别为:KJ486792、KJ486793、KJ486794、KJ486795、KJ486796),采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行疏水性、抗原性及三级结构分析,并与Genbank登录菌株的SeM基因序列进行系统进化分析和比较。克隆获得的SeM基因长度为1 530bp,包含1个1 527bp的完整开放阅读框,编码509个氨基酸;新疆分离株SeM基因与Genbank登录分离株SeM基因同源性为98.0%~99.4%。结果表明,新疆分离株KJ486793、KJ486796与美国分离株亲缘关系较近,属同一个进化分支,另外3株新疆分离株KJ486792、KJ486795、KJ486794构成一个独立分支。

关 键 词:马链球菌马亚种  SeM基因  克隆  生物信息学分析

Cloning and Sequence Difference Analysis of the SeM Gene of Streptococcus equi subsp. equi Isolated in Xinjiang
LIU Yuntao,WANG Caidie,XIA Lining and SU Yan.Cloning and Sequence Difference Analysis of the SeM Gene of Streptococcus equi subsp. equi Isolated in Xinjiang[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2015,24(3):14-19.
Authors:LIU Yuntao  WANG Caidie  XIA Lining and SU Yan
Institution:LIU Yuntao;WANG Caidie;XIA Lining;SU Yan;Veterinary Medicine College,Xinjiang Agricultural University;
Abstract:
Keywords:Streptococcus equi subsp  equi  SeM gene  Cloning  Bioinformatic analysis
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