| 小麦条锈菌新菌系CYR34中CDK5基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 蒋应磊,罗 超,陈诗雯,邵 欣,邹一萍,陶 飞,薛应钰.小麦条锈菌新菌系CYR34中CDK5基因的克隆及生物信息学分析[J].西北农业学报,2024(1):133-140. |
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| 作者姓名： | 蒋应磊 罗 超 陈诗雯 邵 欣 邹一萍 陶 飞 薛应钰 |
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| 作者单位： | （1.甘肃农业大学 植物保护学院，兰州 730070；2.广西大学 农学院，南宁 530004；3.南京农业大学 生命科学学院，南京 210095） |
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| 基金项目： | 国家自然基金地区科学基金（32060595）；甘肃省青年基金（20JR10RA549）；甘肃农业大学人才专项（GAU-KYQD-2018-37）。 |
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| 摘 要： | 为探究细胞周期蛋白依赖性激酶（Cyclin-dependent kinase 5，CDK5）在小麦条锈菌（Puccinia striiformis f. sp. tritici）新菌系CYR34夏孢子萌发过程的毒性作用，以天水地区小麦条锈菌新菌系CYR34夏孢子标样为试材，通过RACE克隆 CDK5基因并对其进行生物信息学分析，获得长度为706 bp，编码190个氨基酸的cDNA序列。蛋白质结构预测显示，其二级结构主要以α-螺旋为主，且具有典型的STKC激酶结构域。同源性分析显示，CDK5与小麦杆锈菌（Puccinia graminis f. sp. tritici）中的CDK5亲缘关系较近。蛋白质互作数据库预测分析发现，CDK5可以与磷酸核酮糖3-差异构酶、荚膜生物合成蛋白、鸟苷酸激酶、丝氨酸/苏氨酸特异性蛋白激酶、16S rRNA 蛋白以及肌苷-5′-单磷酸脱氢酶6个蛋白互作关系；基因时序表达发现在孢子萌发0~6 h时，基因的表达量持续下调，6 h后表现为上调，萌发10 h后为对照的1.2倍，萌发14 h后基因的表达量达趋于平台期，为对照的1.36倍。综上所述，推测细胞周期蛋白依赖性激酶CDK5在小麦条锈菌（CYR34）夏孢子萌发过程中参与了适应环境的信号调控。
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| 关 键 词： | 小麦条锈菌 CDK5 基因克隆 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of CDK5 Gene from a New Wheat Stripe Rust Strain CYR34 |
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| JIANG Yinglei,LUO Chao,CHEN Shiwen,SHAO Xin,ZOU Yiping,TAO Fei and XUE Yingyu.Cloning and Bioinformatics Analysis of CDK5 Gene from a New Wheat Stripe Rust Strain CYR34[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2024(1):133-140. |
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| Authors: | JIANG Yinglei LUO Chao CHEN Shiwen SHAO Xin ZOU Yiping TAO Fei and XUE Yingyu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Puccinia striiformis f sp tritici CDK5 Gene clone Bioinformatics analysis |
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