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葡萄NF-Y核因子家族的鉴定与表达分析
引用本文:马维峰,韩爱民,乃国洁,李艳梅,李彦彪,毛 娟.葡萄NF-Y核因子家族的鉴定与表达分析[J].西北农业学报,2021,30(6):870-882.
作者姓名:马维峰  韩爱民  乃国洁  李艳梅  李彦彪  毛 娟
作者单位:(甘肃农业大学 园艺学院,兰州 730070)
基金项目:高等学校创新能力提升项目(2019B-079);学科建设专项基金(GAU-XKJS-2018-226)。
摘    要:为阐明葡萄NF-Y核因子的理化性质、进化关系和在非生物胁迫下的表达情况,本研究从葡萄全基因组中鉴定出24个VvNF-Y核因子家族成员。生物信息学分析表明其编码的氨基酸数目为132~345 aa, pI为4.62~9.83,蛋白二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主,亚细胞定位发现葡萄NF-Y基因主要定位于细胞核中;系统进化分析表明进化树可分为3个亚族;顺式作用元件分析发现葡萄NF-Y基因家族具有大量核心元件,如光响应元件和响应多种激素和环境信号的元件,且多序列比对分析表明VvNF-Y的3个亚族均含有保守区;此外,选择性压力分析表明8对基因对的Ka/Ks均小于0.5,在进化过程中受到纯化选择作用;qRT-PCR结果表明在500μmol·L~(-1) ABA、10%PEG和200 mmol·L~(-1)NaCl处理时,VvNF-YA2、VvNF-YB3、VvNF-YB4和VvNF-YC3的表达量显著上升,且在10%PEG条件下,VvNF-YA1的表达量也显著上升,其余NF-Y核因子家族成员在受到ABA、NaCl和PEG处理时表达量下降。试验结果表明葡萄NF-Y核因子在参与葡萄不同的非生物胁迫时可能发挥不同的作用,为葡萄抗逆性研究提供了候选基因。

关 键 词:葡萄  NF-Y核因子家族  非生物胁迫  表达分析

Identification and Expression Analysis of NF-Y Nuclear Factor Family in Grape
MA Weifeng,HAN Aimin,NAI Guojie,LI Yanmei,LI Yanbiao and MAO Juan.Identification and Expression Analysis of NF-Y Nuclear Factor Family in Grape[J].Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica,2021,30(6):870-882.
Authors:MA Weifeng  HAN Aimin  NAI Guojie  LI Yanmei  LI Yanbiao and MAO Juan
Abstract:
Keywords:
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