| 利用转录组数据开发意大利蜜蜂的SSR分子标记 |
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| 引用本文： | 郭睿,陈华枝,庄天艺,熊翠玲,郑燕珍,付中民,陈恒,陈大福.利用转录组数据开发意大利蜜蜂的SSR分子标记[J].安徽农业大学学报,2018,45(3):404-408. |
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| 作者姓名： | 郭睿 陈华枝 庄天艺 熊翠玲 郑燕珍 付中民 陈恒 陈大福 |
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| 作者单位： | 福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002;福建农林大学蜂学学院,福州,350002 |
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| 基金项目： | 现代农业产业技术体系建设专项基金(CARS-44-KXJ7)，福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158)，福建省大学生创新创业训练计划项目(201610389113 |
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| 摘 要： | 意大利蜜蜂(简称意蜂)是自然界重要的授粉昆虫,广泛用于世界各国的养蜂生产,具有很高的生态和经济价值。为了开发意蜂的SSR分子标记,利用MISA软件对基于前期获得的意蜂幼虫肠道转录组数据组装得到的12 115条unigenes进行搜索,共预测出分布于2 149条unigenes的6 312个SSR位点,其中主要的重复类型为二核苷酸重复(54.42%)和三核苷酸重复(32.49%),主要基元为AT/AT(31.2%)和AG/CT(18.6%)。进一步利用软件设计出18 444对特异性引物,随机选取24对引物对国内3个不同来源的意蜂幼虫样品进行SSR位点扩增,有22对成功扩增出目的片段。研究开发出的SSR分子标记可用于意蜂的种群遗传和分子进化等研究,结果表明利用转录组数据鉴定非模式生物SSR位点的方法可行且高效。
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| 关 键 词： | 转录组 意大利蜜蜂 SSR 特异性引物 |
| 收稿时间： | 2017/11/8 0:00:00 |
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