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羊口疮病毒安徽株116基因的生物信息学分析及原核表达
引用本文:王勇,张学琪,白彩霞,刘自敏,胡凯,胡子慧,孙裴.羊口疮病毒安徽株116基因的生物信息学分析及原核表达[J].安徽农业大学学报,2020,47(6):894.
作者姓名:王勇  张学琪  白彩霞  刘自敏  胡凯  胡子慧  孙裴
作者单位:安徽农业大学动物科技学院,合肥 230036;淮北市畜牧中心,淮北 235000
基金项目:国家重点研发计划(2018YFD0502006), 2019年国家级大学生创新训练计划(201910364044)和安徽省大学生创新训练计划(201810364023)共同资助。
摘    要:为了对羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)安徽株116基因进行生物信息学分析及原核表达。以ORFVAH-F10株为模板PCR扩增116基因,使用生物信息学软件预测该基因编码蛋白的结构与功能。同时将扩增产物克隆至pET-32a(+)原核表达载体,经BamH I及EcoR I双酶切鉴定后进行测序,构建pET-32a(+)-116重组质粒。转化至大肠杆菌Rosetta(DE3)进行IPTG诱导,纯化蛋白后免疫BALB/c雌性小鼠制备多克隆抗体。测序结果显示,ORFV116基因全长561 bp,编码186个氨基酸。生物信息学分析结果显示:该蛋白分子量约为20.33 kDa,为不稳定亲水性蛋白;无信号肽、保守结构域及跨膜结构域;含有2个N糖基化位点和42个磷酸化位点;二级结构以无规则卷曲为主,分别为延伸链(5.91%)、α-螺旋(14.52%)与无规则卷曲(79.57%);预测该蛋白含有20个可能的B细胞优势抗原表位与4个CTL细胞表位。SDS-PAGE及Western-blot结果显示,ORFV116蛋白大小约为51 kDa,主要以可溶形式表达且具有良好的反应原性。

关 键 词:羊口疮病毒  116基因  生物信息学分析  原核表达

Bioinformatics analysis and prokaryotic expression of Orf virus Anhui strain 116 gene
WANG Yong,ZHANG Xueqi,BAI Caixi,LIU Zimin,HU Kai,HU Zihui,SUN Pei.Bioinformatics analysis and prokaryotic expression of Orf virus Anhui strain 116 gene[J].Journal of Anhui Agricultural University,2020,47(6):894.
Authors:WANG Yong  ZHANG Xueqi  BAI Caixi  LIU Zimin  HU Kai  HU Zihui  SUN Pei
Institution:School of Animal Science and Technology, Anhui Agricultural University, Hefei 230036;Animal Husbandry Center of Huaibei, Huaibei 235000
Abstract:
Keywords:Orf virus  116 gene  Bioinformatics analysis  Prokaryotic expression
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