| 茶树转录组中SSR位点的信息分析 |
| |
| 引用本文： | 杨华,陈琪,韦朝领,史成颖,方从兵,宛晓春.茶树转录组中SSR位点的信息分析[J].安徽农业大学学报,2011,38(6):882-886. |
| |
| 作者姓名： | 杨华 陈琪 韦朝领 史成颖 方从兵 宛晓春 |
| |
| 作者单位： | 安徽农业大学农业部茶及药用植物安全生产重点开放实验室,合肥230036;安徽农业大学理学院,合肥230036;安徽农业大学农业部茶及药用植物安全生产重点开放实验室,合肥,230036;安徽农业大学农业部茶及药用植物安全生产重点开放实验室,合肥230036;安徽农业大学园艺学院,合肥230036 |
| |
| 基金项目： | “十二五”国家科技支撑计划(2011BAD01B01);教育部、农业部重点实验室开放基金项目(ltbb201102042)共同资助 |
| |
| 摘 要： | 利用茶树全转录组的高通量测序获得的127 094条Unigenes来发掘茶树转录组SSR功能性标记。在这些序列中共搜索出12 242个SSRs,分布于10 325条Unigenes中,出现频率为9.63%。茶树转录组SSRs的平均长度为16 bp,平均分布频率是1/3.68 kb。在茶树转录组的SSRs中,二核苷酸重复是主要的类型,占总SSRs的63.78%。茶树转录组SSRs共包含181种重复基元,二核苷酸重复基元CT/AG和TC/GA是优势重复基元类型,分别占总SSRs的23.84%和23.58%。同时对这些SSR的可用性进行了评价。
|
| 关 键 词： | 茶树 转录组 SSR信息 |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《安徽农业大学学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《安徽农业大学学报》下载免费的PDF全文 |
|
