| 高粱生长素反应因子(ARF)基因的全基因组分析与进化研究 |
| |
| 引用本文： | 江海洋,魏巍,刘艳,朱苏文,程备久.高粱生长素反应因子(ARF)基因的全基因组分析与进化研究[J].安徽农业大学学报,2010,37(3). |
| |
| 作者姓名： | 江海洋 魏巍 刘艳 朱苏文 程备久 |
| |
| 作者单位： | 安徽农业大学生命科学学院,合肥,230036;安徽农业大学生命科学学院,合肥,230036;安徽农业大学生命科学学院,合肥,230036;安徽农业大学生命科学学院,合肥,230036;安徽农业大学生命科学学院,合肥,230036 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，安徽省自然科学基金 |
| |
| 摘 要： | 生长素在植物发育中的各个阶段都起着重要作用,而生长素反应因子(auxin response factors,ARF)特异性的调节生长素反应基因的表达,是植物细胞中重要的一类转录因子家族.在拟南芥、玉米、水稻等模式作物中先后克隆了一些ARF基因,但是高粱作为一种重要的经济作物,这方面的研究未见报道.随着高粱全基因组序列的公布,利用基因组序列分析ARF基因的数目、结构、进化具有重要的意义.利用公布的高粱全基因组数据,利用DNATOOLS、BLAST、MEGA4.0以及Genomepixelizer等生物信息学软件对高粱(Sorghum bicolor)生长素反应因子ARF基因的数量、物理位置、系统进化树、氨基酸序列及保守基序(motif)的保守性等进行分析. 结果表明, 在高粱全基因组中共有26个ARF基因,26个ARF基因根据其进化关系分为A、B、C 3类; 通过对全基因组内ARF基因进行物理位置和基因家族分析,发现高粱基因组中ARF基因存在明显的基因复制现象, 基因的复制对高粱基因组中ARF基因数量扩张起到了重要的作用.
|
| 关 键 词： | 高粱 ARF基因 进化分析 保守基序 |
Genome-wide analysis and evolution of the auxin response factor (ARF) gene family in Sorghum bicolor |
| |
| JIANG Hai-yang,WEI Wei,LIU Yan,ZHU Su-wen,CHENG Bei-jiu.Genome-wide analysis and evolution of the auxin response factor (ARF) gene family in Sorghum bicolor[J].Journal of Anhui Agricultural University,2010,37(3). |
| |
| Authors: | JIANG Hai-yang WEI Wei LIU Yan ZHU Su-wen CHENG Bei-jiu |
| |
| Institution: | JIANG Hai-yang,WEI Wei,LIU Yan,ZHU Su-wen,CHENG Bei-jiu(School of Life Science,Anhui Agricultural University,Hefei 230036) |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Sorghum bicolor ARF genes evolution analysis conserved motif |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《安徽农业大学学报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《安徽农业大学学报》下载免费的PDF全文 |
|
