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苹果IRAP反应体系的建立和指纹图谱构建
引用本文:周军永,孙其宝,孙俊,王昆.苹果IRAP反应体系的建立和指纹图谱构建[J].安徽农业大学学报,2010,37(3).
作者姓名:周军永  孙其宝  孙俊  王昆
作者单位:安徽农业大学园艺学院,合肥,230036;安徽省农业科学院园艺研究所,合肥,230031;中国农业科学院果树研究所,兴城,125100
基金项目:国家自然科学基金,安徽农业大学稳定与引进人才科研启动专项基金 
摘    要:利用已获得的苹果Ty1-copia类逆转座子LTRs建立了苹果逆转座子间扩增多态性(IRAP)技术体系,对影响IRAP-PCR扩增结果的若干因子进行了研究.优化的反应体系包含:2.5 μL 10×buffer,50 ng模板DNA,2.5 mmol·L-1 Mg2+,0.2 mmol·L-1 dNTPs,0.4 μmol·L-1引物,1 U Taq DNA聚合酶,反应体积为25 μL;优化的PCR扩增程序为:94℃ 2 min; 94℃ 1 min,退火1 min,72℃ 2 min,循环35次;72℃延伸10 min;退火温度根据引物温度设定.该IRAP体系分别用于‘元帅'和‘富士'的短枝和着色芽变指纹图谱的分析,构建的指纹图谱可以作为芽变鉴定的依据,表明这些突变可能系逆转座子转座插入或逆转座子间重组所致.

关 键 词:苹果  逆转座子  IRAP-PCR  指纹图谱

Establishment of the inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) reaction system and construction of fingerprint in Malus genus
ZHOU Jun-yong,SUN Qi-bao,SUN Jun,WANG Kun.Establishment of the inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) reaction system and construction of fingerprint in Malus genus[J].Journal of Anhui Agricultural University,2010,37(3).
Authors:ZHOU Jun-yong  SUN Qi-bao  SUN Jun  WANG Kun
Institution:ZHOU Jun-yong1,SUN Qi-bao2,SUN Jun1,WANG Kun3(1.School of Horticulture,Anhui Agricultural University,Hefei 230036,2.Horticulture Research Institute,Anhui Academy of Agriculture Science,Hefei 230031,3.Research Institute of Pomology,CAAS,Xingcheng 125100)
Abstract:
Keywords:IRAP-PCR
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